RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 SERINC5Q86VE9 423 aa22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 GJB5O95377 273 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 AMHP03971 560 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 COG5Q9UP83 839 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.18■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 CDH23Q9H251 3354 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 PIK3CDO00329 1044 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 GRB10Q13322 594 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM117BQ6P1L5 589 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 TET1Q8NFU7 2136 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 WNT8BQ93098 351 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SENP7Q9BQF6 1050 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 INSL6Q9Y581 213 aa22.17■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 EPOPA6NHQ4 379 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 CAND2O75155 1236 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 LIFRP42702 1097 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SP4Q02446 784 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 HIC1Q14526 733 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SEPT8Q92599 483 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 CDHR1Q96JP9 859 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR20Q99678 358 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.16■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 LCHNA4D1U4 455 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 MEIS2O14770 477 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC27A2O14975 620 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 TREHO43280 583 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SETD4Q9NVD3 440 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 LMCD1Q9NZU5 365 aa22.15■■□□□ 1.14
SH3BP2-220ENST00000511663 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGEF15O94989 841 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 TFF2Q03403 129 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 MBTPS1Q14703 1052 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF20Q5VTR2 975 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 KRT40Q6A162 431 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 MYOCDQ8IZQ8 938 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 HLA-CQ95604 372 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 EHMT1Q9H9B1 1298 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 MTUS1Q9ULD2 1270 aa22.14■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 RXRAP19793 462 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 ERVK-21P61565 698 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 TCTN1Q2MV58 587 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.131e-11■■■■■ 35.9
SH3BP2-220ENST00000511663 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 FANCBQ8NB91 859 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 GPRASP2Q96D09 838 aa22.13■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 EYSQ5T1H1 3165 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 NRCAMQ92823 1304 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 CTSHP09668 335 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 BMP1P13497 986 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 HOXC8P31273 242 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 ARHGAP4P98171 946 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 SEMA3FQ13275 785 aa22.12■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 LINC01553A4QN01 128 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 MAFGO15525 162 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 NECTIN1Q15223 517 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 SUGCTQ9HAC7 445 aa22.11■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 LPXNO60711 386 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 MTMR1Q13613 665 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 RSPH3Q86UC2 560 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 TRIM50Q86XT4 487 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 GDPD5Q8WTR4 605 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 APBB2Q92870 758 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 GLG1Q92896 1179 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.1■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNQ1P51787 676 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 SPRED2Q7Z698 418 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 MICU3Q86XE3 530 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 FBXO22Q8NEZ5 403 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 YME1L1Q96TA2 773 aa22.09■■□□□ 1.13
SH3BP2-220ENST00000511663 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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