RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 HIC1Q14526 733 aa28.38■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF618Q5T7W0 954 aa28.38■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 TMTC3Q6ZXV5 915 aa28.38■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 NLRX1Q86UT6 975 aa28.38■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 PSTPIP2Q9H939 334 aa28.38■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 PRDM6Q9NQX0 595 aa28.38■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 TRAF7Q6Q0C0 670 aa28.37■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa28.37■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 SERINC5Q86VE9 423 aa28.37■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 FANCBQ8NB91 859 aa28.37■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 GPR20Q99678 358 aa28.37■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 USP26Q9BXU7 913 aa28.37■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 THEGQ9P2T0 379 aa28.37■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 TLL1O43897 1013 aa28.36■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa28.36■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa28.36■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 TJAP1Q5JTD0 557 aa28.36■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC82Q8N4S0 544 aa28.36■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 ATP6V0A1Q93050 837 aa28.36■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 NEK1Q96PY6 1258 aa28.36■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 SENP7Q9BQF6 1050 aa28.36■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa28.35■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 HOXC8P31273 242 aa28.35■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 CERS4Q9HA82 394 aa28.35■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 EMSYQ7Z589 1322 aa28.35■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa28.34■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 EFCAB14O75071 495 aa28.34■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 THPOP40225 353 aa28.34■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 DEFB103AP81534 67 aa28.34■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 SP4Q02446 784 aa28.34■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 TAP1Q03518 808 aa28.34■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 MBTPS1Q14703 1052 aa28.34■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 APOA5Q6Q788 366 aa28.34■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa28.34■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 TRIM50Q86XT4 487 aa28.34■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 MICALL1Q8N3F8 863 aa28.34■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 GPRASP2Q96D09 838 aa28.34■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 SPDYE3A6NKU9 549 aa28.33■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 CDC45O75419 566 aa28.33■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGEF15O94989 841 aa28.33■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 IKBKEQ14164 716 aa28.33■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 UBE2SQ16763 222 aa28.33■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 TCTN1Q2MV58 587 aa28.33■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 CDHR1Q96JP9 859 aa28.33■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa28.33■■■□□ 2.13
ALYREF-203ENST00000511412 RSPH10B2B2RC85 870 aa28.32■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 TREHO43280 583 aa28.32■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 LGR5O75473 907 aa28.32■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 RSPH10BP0C881 870 aa28.32■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 ARNTL2Q8WYA1 636 aa28.32■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 ZBED2Q9BTP6 218 aa28.32■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 RNPEPQ9H4A4 650 aa28.32■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 GNAT1P11488 350 aa28.31■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 TCEANC2Q96MN5 208 aa28.31■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 TELO2Q9Y4R8 837 aa28.31■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 EPOPA6NHQ4 379 aa28.3■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 RFXAPO00287 272 aa28.3■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 CAND2O75155 1236 aa28.3■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 EHMT1Q9H9B1 1298 aa28.3■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 MICAL3Q7RTP6 2002 aa28.3■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 ZBTB43O43298 467 aa28.29■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 GJB5O95377 273 aa28.29■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 KCNA2P16389 499 aa28.29■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 ITGB5P18084 799 aa28.29■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 MTMR1Q13613 665 aa28.29■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 KRT32Q14532 448 aa28.29■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 RTN1Q16799 776 aa28.29■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 TSGA10IPQ3SY00 556 aa28.29■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 WWC2Q6AWC2 1192 aa28.29■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 SETD4Q9NVD3 440 aa28.29■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 PCDHA6Q9UN73 950 aa28.29■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa28.29■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 LCHNA4D1U4 455 aa28.28■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 ADCK5Q3MIX3 580 aa28.28■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 PPP1R18Q6NYC8 613 aa28.28■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 RASEFQ8IZ41 740 aa28.28■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa28.28■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 MTCH2Q9Y6C9 303 aa28.28■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 ATP9AO75110 1047 aa28.27■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 CTSHP09668 335 aa28.27■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 NAPAP54920 295 aa28.27■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 ARHGAP4P98171 946 aa28.27■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 DBF4BQ8NFT6 615 aa28.27■■■□□ 2.12
ALYREF-203ENST00000511412 LMBR1Q8WVP7 490 aa28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms