RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 CUL5Q93034 780 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 PRDM12Q9H4Q4 367 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 PSTPIP2Q9H939 334 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.61□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 NID2Q14112 1375 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 H3BRB1 525 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 ZBTB43O43298 467 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 NEDD9Q14511 834 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 RTN1Q16799 776 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 SERINC5Q86VE9 423 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 CCDC155Q8N6L0 562 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 MSRAQ9UJ68 235 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.6□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 STXBP3O00186 592 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 DLL1O00548 723 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 ADAM17P78536 824 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 KRT32Q14532 448 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 GPRASP2Q96D09 838 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC9A7Q96T83 725 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 PCDHA6Q9UN73 950 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa14.59□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.58□□□□□ -0.07
SH3BP2-216ENST00000510193 SIP14410 1827 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 C17orf102A2RUQ5 167 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 NOP56O00567 594 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 ADAMTS3O15072 1205 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 TREHO43280 583 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 BAIAP3O94812 1187 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 CA3P07451 260 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 ACTN1P12814 892 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 RCAN1P53805 252 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 DEFB103AP81534 67 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 SPRED2Q7Z698 418 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 NLRX1Q86UT6 975 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 PGBD1Q96JS3 809 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 USP26Q9BXU7 913 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 SLC28A3Q9HAS3 691 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 EPOPA6NHQ4 379 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 CLK2P49760 499 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 NAPAP54920 295 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 SP4Q02446 784 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 APOBRQ0VD83 1088 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 CNKSR3Q6P9H4 555 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 Q6ZUG5 572 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 JADE2Q9NQC1 790 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 SETD4Q9NVD3 440 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM260Q9NX78 707 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 PARNO95453 639 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 NEFLP07196 543 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 MTMR1Q13613 665 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 FBXL16Q8N461 479 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 BRF1Q92994 677 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 PCYT2Q99447 389 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 ANO3Q9BYT9 981 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 BARHL2Q9NY43 387 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 PKD2L1Q9P0L9 805 aa14.56□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 LCHNA4D1U4 455 aa14.55□□□□□ -0.08
SH3BP2-216ENST00000510193 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms