RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa17.37■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 COL6A3P12111 3177 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BAIAP3O94812 1187 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FOSP01100 380 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LGALS2P05162 132 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CKBP12277 381 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PSMA5P28066 241 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NAPAP54920 295 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WWC2Q6AWC2 1192 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BCAS3Q9H6U6 928 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RIC8AQ9NPQ8 531 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNX14Q9Y5W7 946 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa17.36■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 C17orf102A2RUQ5 167 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GNAT1P11488 350 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ITGB5P18084 799 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBE2SQ16763 222 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SERINC5Q86VE9 423 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SLC9A7Q96T83 725 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa17.35■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HOXC8P31273 242 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADCY7P51828 1080 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MTMR1Q13613 665 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 Q6ZUG5 572 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP6V0A1Q93050 837 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 JADE2Q9NQC1 790 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BARHL2Q9NY43 387 aa17.34■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYH7BA7E2Y1 1941 aa17.33■□□□□ 0.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMCO2A6NFE2 343 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 STXBP3O00186 592 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CXCL10P02778 98 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCNA2P16389 499 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RPS6KB1P23443 525 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CDC27P30260 824 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADD1P35611 737 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GPNMBQ14956 572 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SEPT1Q8WYJ6 367 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BRF1Q92994 677 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RNPEPQ9H4A4 650 aa17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EMSYQ7Z589 1322 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIF28PB7ZC32 967 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EFCAB14O75071 495 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATP9AO75110 1047 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CAND2O75155 1236 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CPA1P15085 419 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCNJ6P48051 423 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RABGGTBP53611 331 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 APOBRQ0VD83 1088 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AP3B2Q13367 1082 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HIC1Q14526 733 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF618Q5T7W0 954 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERICH6BQ5W0A0 696 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MCTP2Q6DN12 878 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TYW1BQ6NUM6 668 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CNKSR3Q6P9H4 555 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 AGXT2Q9BYV1 514 aa17.32■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NBNO60934 754 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 THPOP40225 353 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SP4Q02446 784 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HERC6Q8IVU3 1022 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MXRA8Q9BRK3 442 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRDM12Q9H4Q4 367 aa17.31■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NRCAMQ92823 1304 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RSPH10B2B2RC85 870 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RSPH10BP0C881 870 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCG2P13521 617 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EVCP57679 992 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IKBKEQ14164 716 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEP55Q53EZ4 464 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP2R2DQ66LE6 453 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRAF7Q6Q0C0 670 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WNT8BQ93098 351 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ANO3Q9BYT9 981 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KCNH7Q9NS40 1196 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SETD4Q9NVD3 440 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PPP4R2Q9NY27 417 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERAP1Q9NZ08 941 aa17.3■□□□□ 0.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NID2Q14112 1375 aa17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms