RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 NR3C2P08235 984 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 STAG3L1P0CL83 205 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 DEFB128Q7Z7B8 93 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 ASIC4Q96FT7 647 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 NECTIN4Q96NY8 510 aa9□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 IL9P15248 144 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 PLCB3Q01970 1234 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 PGM5Q15124 567 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 GNPTABQ3T906 1256 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 TCEAL5Q5H9L2 206 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 PCNX4Q63HM2 1172 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 NIPA1Q7RTP0 329 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 RSPH3Q86UC2 560 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 PANK1Q8TE04 598 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 ZBED2Q9BTP6 218 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 MX1P20591 662 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.99□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 OPLAHO14841 1288 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 FAM189BP81408 668 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 GRM4Q14833 912 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 DUSP6Q16828 381 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 TTC3P53804 2025 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 ZBTB5O15062 677 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 IRS1P35568 1242 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 GIT2Q14161 759 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 PTPN21Q16825 1174 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 RNF135Q8IUD6 432 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 TAAR1Q96RJ0 339 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 RMDN3Q96TC7 470 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 NR2E1Q9Y466 385 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 LGALS2P05162 132 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 TCF15Q12870 199 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM63BQ5T3F8 832 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 ARHGEF16Q5VV41 709 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 PPP1R18Q6NYC8 613 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 MFSD6Q6ZSS7 791 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 ADGRF4Q8IZF3 695 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 GPR20Q99678 358 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 JMJD4Q9H9V9 463 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 AAASQ9NRG9 546 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 HOMER2Q9NSB8 354 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 COL20A1Q9P218 1284 aa8.98□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 RFXAPO00287 272 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 HOXA2O43364 376 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 FGAP02671 866 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 POU2F2P09086 479 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 SEC23AQ15436 765 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 IQCA1Q86XH1 822 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 PPM1EQ8WY54 764 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 C17orf80Q9BSJ5 609 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 FSD1Q9BTV5 496 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 S1PR5Q9H228 398 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 ATG7O95352 703 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 CALML3P27482 149 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 CLCN5P51795 746 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 IKQ13123 557 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 NLRX1Q86UT6 975 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 STX8Q9UNK0 236 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 PLAGL2Q9UPG8 496 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 USTQ9Y2C2 406 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa8.97□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 H3BRB1 525 aa8.96□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 STXBP3O00186 592 aa8.96□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 ENPP3O14638 875 aa8.96□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 QRICH1Q2TAL8 776 aa8.96□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 FAM47CQ5HY64 1035 aa8.96□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 FBXO47Q5MNV8 452 aa8.96□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP8.96□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 DBF4BQ8NFT6 615 aa8.96□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.96□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 TET1Q8NFU7 2136 aa8.96□□□□□ -0.97
PDE4D-210ENST00000503258 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 RCAN1P53805 252 aa8.96□□□□□ -0.98
PDE4D-210ENST00000503258 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms