RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 DYMQ7RTS9 669 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 ZSCAN30Q86W11 494 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 JADE2Q9NQC1 790 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 PLA2G4BP0C869 781 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 PAK1Q13153 545 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 ARHGEF16Q5VV41 709 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 UNC13DQ70J99 1090 aa29.11■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 RIT2Q99578 217 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP29.1■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 BTBD7Q9P203 1132 aa29.1■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 MOGSQ13724 837 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 B3GNT9Q6UX72 402 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 MB21D1Q8N884 522 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 NELFBQ8WX92 580 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 HSD17B14Q9BPX1 270 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 MAF1Q9H063 256 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 CYP39A1Q9NYL5 469 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 NRBP1Q9UHY1 535 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 PSMC6P62333 389 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 PDE4CQ08493 712 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 STK4Q13043 487 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 TEKT3Q9BXF9 490 aa29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 PEX10O60683 326 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 SERPINC1P01008 464 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 CYP4A11Q02928 519 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 DNAJC19Q96DA6 116 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 UNC45AQ9H3U1 944 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 RGL1Q9NZL6 768 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 A0A0G2JMZ2 1700 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 CHMP2AO43633 222 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 COBLO75128 1261 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 FCER1AP12319 257 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 GJA5P36382 358 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 PDCL3Q9H2J4 239 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF408Q9H9D4 720 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 DNM3Q9UQ16 869 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP29.08■■■□□ 2.25
HOXB3-212ENST00000498678 SLC12A3P55017 1021 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 UBASH3AP57075 661 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 MTMR1Q13613 665 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 CHST13Q8NET6 341 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 RRAGCQ9HB90 399 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 TUFT1Q9NNX1 390 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 XRRA1Q6P2D8 792 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 DHX15O43143 795 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 SLITRK3O94933 977 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 STIM1Q13586 685 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 CDKAL1Q5VV42 579 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC186Q7Z3E2 898 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 VSIG10LQ86VR7 867 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 KCTD17Q8N5Z5 321 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 HPS3Q969F9 1004 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 SLC10A4Q96EP9 437 aa29.06■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 TPM3P06753 285 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 NR3C2P08235 984 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 IDEP14735 1019 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 CYP11B2P19099 503 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 EHHADHQ08426 723 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 GPBP1Q86WP2 473 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 RIOX2Q8IUF8 465 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 DYDC2Q96IM9 177 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 PKD2L1Q9P0L9 805 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 CBFA2T2O43439 604 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 HERVK_113P62684 666 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC144BQ3MJ40 725 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 COBLL1Q53SF7 1204 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 KIAA0895Q8NCT3 520 aa29.05■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 UNCXA6NJT0 531 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 PTGS1P23219 599 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 EPHA7Q15375 998 aa29.04■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 PSMA7O14818 248 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 CCND2P30279 289 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 ARSHQ5FYA8 562 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 GPAT2Q6NUI2 795 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 SPATC1LQ9H0A9 340 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 SLC39A2Q9NP94 309 aa29.03■■■□□ 2.24
HOXB3-212ENST00000498678 PMS1P54277 932 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms