RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498478.1

ITGB6-210, Transcript of integrin subunit beta 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB6, Length 705 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6-210ENST00000498478 TSPAN6O43657 245 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 SLC9A1P19634 815 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 CORO7P57737 925 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 DDB1Q16531 1140 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 MROH9Q5TGP6 573 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 BROXQ5VW32 411 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 GALNT18Q6P9A2 607 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 EP400NLQ6ZTU2 488 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 WFDC3Q8IUB2 231 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 EFHBQ8N7U6 833 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 ANKS4BQ8N8V4 417 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 HOOK2Q96ED9 719 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 PLCD4Q9BRC7 762 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 MENTQ9BUN1 341 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 DSEQ9UL01 958 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 TAF6LQ9Y6J9 622 aa8.43□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 NOTOA8MTQ0 251 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 AKAP10O43572 662 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 FBXO21O94952 628 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 NTRK1P04629 796 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 PRKCAP17252 672 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 SESN3P58005 492 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 ERVK-21P61565 698 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 RBM10P98175 930 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 FAPQ12884 760 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 ZNF174Q15697 407 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 RIOX2Q8IUF8 465 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 KIAA1958Q8N8K9 716 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 NUP43Q8NFH3 380 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 CHMP4CQ96CF2 233 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 CD244Q9BZW8 370 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 SLC6A20Q9NP91 592 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 PDLIM7Q9NR12 457 aa8.42□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 SCDO00767 359 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 COBLO75128 1261 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 MED26O95402 600 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 CHRNEQ04844 493 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 ABCB5Q2M3G0 1257 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 SPPL2CQ8IUH8 684 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 PASD1Q8IV76 773 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 NOSTRINQ8IVI9 506 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 SCYL1Q96KG9 808 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 TOMM22Q9NS69 142 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 ZIM2Q9NZV7 527 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 ACSL6Q9UKU0 697 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 SRPK3Q9UPE1 567 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 SPEF1Q9Y4P9 236 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.41□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 K7ESF4 209 aa8.4□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 KRIT1O00522 736 aa8.4□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 NRDCO43847 1150 aa8.4□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 EFEMP2O95967 443 aa8.4□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 SCGB1D2O95969 90 aa8.4□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 MYBL2P10244 700 aa8.4□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 IARSP41252 1262 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 KIF11P52732 1056 aa8.4□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 PTPN21Q16825 1174 aa8.4□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 CPZQ66K79 652 aa8.4□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ITGB6-210ENST00000498478 A0A1W2PQJ5 194 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 SLC27A2O14975 620 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 HIP1RO75146 1068 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 MT-CO1P00395 513 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 PRNPP04156 253 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 ERVFC1P60507 584 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 SEC23AQ15436 765 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 TERF2Q15554 542 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 INAVAQ3KP66 663 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 STEAP3Q658P3 488 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 CHPFQ8IZ52 775 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 OXR1Q8N573 874 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 PDZD8Q8NEN9 1154 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 MS4A5Q9H3V2 200 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 PCIF1Q9H4Z3 704 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 ATP23Q9Y6H3 246 aa8.39□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 LSP1P33241 339 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 CYP4F8P98187 520 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 FIGNQ5HY92 759 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 FLCNQ8NFG4 579 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 DLG3Q92796 817 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 C8orf48Q96LL4 319 aa8.38□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ITGB6-210ENST00000498478 C19orf44Q9H6X5 657 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms