RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496298.5

USP40-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 40, humanhuman

TSL 2

Gene USP40, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP40-217ENST00000496298 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa22.25■■□□□ 1.15
USP40-217ENST00000496298 SPDYE3A6NKU9 549 aa22.25■■□□□ 1.15
USP40-217ENST00000496298 H3BRB1 525 aa22.25■■□□□ 1.15
USP40-217ENST00000496298 STXBP3O00186 592 aa22.25■■□□□ 1.15
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USP40-217ENST00000496298 CDHR1Q96JP9 859 aa22.25■■□□□ 1.15
USP40-217ENST00000496298 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
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USP40-217ENST00000496298 GPNMBQ14956 572 aa22.24■■□□□ 1.15
USP40-217ENST00000496298 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
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USP40-217ENST00000496298 ACTN1P12814 892 aa22.23■■□□□ 1.15
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USP40-217ENST00000496298 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
USP40-217ENST00000496298 RAB30Q15771 203 aa22.23■■□□□ 1.15
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USP40-217ENST00000496298 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
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USP40-217ENST00000496298 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.22■■□□□ 1.15
USP40-217ENST00000496298 SERINC5Q86VE9 423 aa22.22■■□□□ 1.15
USP40-217ENST00000496298 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.22■■□□□ 1.15
USP40-217ENST00000496298 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.22■■□□□ 1.15
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USP40-217ENST00000496298 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.2■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.2■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.2■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 RNPEPQ9H4A4 650 aa22.2■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa22.2■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 MYO9BQ13459 2157 aa22.2■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 CDH23Q9H251 3354 aa22.2■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 ESYT2A0FGR8 921 aa22.19■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.19■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 ZBBXA8MT70 800 aa22.19■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 BAIAP3O94812 1187 aa22.19■■□□□ 1.14
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USP40-217ENST00000496298 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.18■■□□□ 1.14
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USP40-217ENST00000496298 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.18■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 A0A0C4DFX4 3053 aa22.17■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 IFNAR1P17181 557 aa22.17■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USP40-217ENST00000496298 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
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