RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496043.5

PTPRF-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRF, Length 415 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-214ENST00000496043 GOLGA8AA7E2F4 631 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 GOLGA8BA8MQT2 603 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 BAIAP3O94812 1187 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 GNAT1P11488 350 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 GPNMBQ14956 572 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 UBE2SQ16763 222 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 SLC9A7Q96T83 725 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 RNPEPQ9H4A4 650 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 MYH7BA7E2Y1 1941 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 CXCL10P02778 98 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 MYOGP15173 224 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 HSPA4P34932 840 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 KCNJ6P48051 423 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 RCAN1P53805 252 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 NAPAP54920 295 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 FUT2Q10981 343 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 HIC1Q14526 733 aa14.61□□□□□ -0.07
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PTPRF-214ENST00000496043 ZNF618Q5T7W0 954 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 ATP6V0A1Q93050 837 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 RIC8AQ9NPQ8 531 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.61□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 SMCO2A6NFE2 343 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 hCG_1984214I3L0E3 225 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 NBNO60934 754 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 ATP9AO75110 1047 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 REC8O95072 547 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 NEFLP07196 543 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 ITGB5P18084 799 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 PSMA5P28066 241 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 THPOP40225 353 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 SP4Q02446 784 aa14.6□□□□□ -0.07
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PTPRF-214ENST00000496043 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 Q6ZUG5 572 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 SERINC5Q86VE9 423 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 HERC6Q8IVU3 1022 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 JADE2Q9NQC1 790 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.6□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.6□□□□□ -0.07
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PTPRF-214ENST00000496043 RSPH10BP0C881 870 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 CPA1P15085 419 aa14.59□□□□□ -0.07
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PTPRF-214ENST00000496043 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
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PTPRF-214ENST00000496043 APOBRQ0VD83 1088 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 MTMR1Q13613 665 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 WNT8BQ93098 351 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 MXRA8Q9BRK3 442 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 SETD4Q9NVD3 440 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 BARHL2Q9NY43 387 aa14.59□□□□□ -0.07
PTPRF-214ENST00000496043 STXBP3O00186 592 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 HOXC8P31273 242 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 TRAF7Q6Q0C0 670 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 FBXL16Q8N461 479 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 PPM1EQ8WY54 764 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 BRF1Q92994 677 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 ZBED2Q9BTP6 218 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 TELO2Q9Y4R8 837 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 EMSYQ7Z589 1322 aa14.58□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 COL6A3P12111 3177 aa14.58□□□□□ -0.08
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PTPRF-214ENST00000496043 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 TLL1O43897 1013 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 CAND2O75155 1236 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 LGR5O75473 907 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 CA3P07451 260 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 RPS6KB1P23443 525 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 WDR5P61964 334 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 ARHGAP4P98171 946 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 ADGRE1Q14246 886 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 TYW1BQ6NUM6 668 aa14.57□□□□□ -0.08
PTPRF-214ENST00000496043 TRIM50Q86XT4 487 aa14.57□□□□□ -0.08
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