RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493315.1

WDPCP-217, Transcript of WD repeat containing planar cell polarity effector, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene WDPCP, Length 1,476 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDPCP-217ENST00000493315 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 LRRC8AQ8IWT6 810 aa8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 LPAR1Q92633 364 aa8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 SPSB2Q99619 263 aa8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 NT5C3AQ9H0P0 336 aa8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 HSD3B7Q9H2F3 369 aa8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 AS3MTQ9HBK9 375 aa8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 SPON1Q9HCB6 807 aa8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 RWDD2AQ9UIY3 292 aa8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 PYCARDQ9ULZ3 195 aa8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 PCDHA12Q9UN75 941 aa8.7□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 SBF1O95248 1867 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 PIK3CDO00329 1044 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 PSMA7O14818 248 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 TBX3O15119 743 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 RHOBTB3O94955 611 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 CFBP00751 764 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 POLR2MP0CAP2 368 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 LMNB1P20700 586 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 CYP3A7P24462 503 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 USP14P54578 494 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 SPAG1Q07617 926 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 LRMPQ12912 555 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 GRB10Q13322 594 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 FILIP1LQ4L180 1135 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 PRR16Q569H4 304 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 HAUS3Q68CZ6 603 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 ERMNQ8TAM6 284 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 KIAA1524Q8TCG1 905 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 NELFBQ8WX92 580 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 TEPSINQ96N21 525 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 PICK1Q9NRD5 415 aa8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 EDIL3O43854 480 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 OFD1O75665 1012 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 ZNF18P17022 549 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 PRELPP51888 382 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 PDE4DQ08499 809 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 MCM6Q14566 821 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 Q4G0T1 1027 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 TMEM119Q4V9L6 283 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 VSTM4Q8IW00 320 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 RAD54LQ92698 747 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 HAS1Q92839 578 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 MBOAT7Q96N66 472 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 SLF1Q9BQI6 1058 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 TRIM9Q9C026 710 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 KCNMB3Q9NPA1 279 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 GPRC5DQ9NZD1 345 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 CCPG1Q9ULG6 757 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 GDAQ9Y2T3 454 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.68□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 BICDL2A1A5D9 508 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 KLRC4O43908 158 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 ICAM1P05362 532 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 CYP3A4P08684 503 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 PRCPP42785 496 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 NCAPH2Q6IBW4 605 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 LDHDQ86WU2 507 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 SCUBE3Q8IX30 993 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 SCYL3Q8IZE3 742 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 GPC2Q8N158 579 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 FAM20AQ96MK3 541 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 PNMA5Q96PV4 448 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 WRNIP1Q96S55 665 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 FBXO28Q9NVF7 368 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 GGA3Q9NZ52 723 aa8.67□□□□□ -1.02
WDPCP-217ENST00000493315 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.3 ms