RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	CCDC140	Q96MF4	163 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		5.11	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	B4GALT4	O60513	344 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	CP	P00450	1065 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	KNG1	P01042	644 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	LTBR	P36941	435 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	MIIP	Q5JXC2	388 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952		Q6ZUG5	572 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	USP51	Q70EK9	711 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	PALM2	Q8IXS6	379 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	DEF6	Q9H4E7	631 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	FTSJ1	Q9UET6	329 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		5.1	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF503	Q96F45	646 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	KATNBL1	Q9H079	304 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	MYOT	Q9UBF9	498 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	CROT	Q9UKG9	612 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TTC3-222	ENST00000491952	PLSCR1	O15162	318 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	FOXS1	O43638	330 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	MYO1B	O43795	1136 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	CSF2RB	P32927	897 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	FOXE3	Q13461	319 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM145	Q8NBT3	493 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	PCDHA2	Q9Y5H9	948 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	ECI1	P42126	302 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	AMER2	Q8N7J2	671 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	EDA	Q92838	391 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	DLL4	Q9NR61	685 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	KCND1	Q9NSA2	647 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	SUSD5	O60279	629 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	DGKI	O75912	1065 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952		Q6ZSN1	163 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	GNRHR2	Q96P88	292 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	CLDND1	Q9NY35	253 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	MAP4K2	Q12851	820 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	FAH	P16930	419 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	DUSP8	Q13202	625 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	JADE2	Q9NQC1	790 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	GPR27	Q9NS67	375 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	MAFK	O60675	156 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	MSC	O60682	206 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	IL18BP	O95998	194 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	CKM	P06732	381 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	GRIA2	P42262	883 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	EPHA5	P54756	1037 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	PRKD1	Q15139	912 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	PHF19	Q5T6S3	580 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	AGBL4	Q5VU57	503 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	LMF1	Q96S06	567 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
TTC3-222	ENST00000491952		B2RBV5	119 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	KRIT1	O00522	736 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	VASN	Q6EMK4	673 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TTC3-222	ENST00000491952	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61

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