RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 COG1Q8WTW3 980 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 TRHDEQ9UKU6 1024 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 SPO11Q9Y5K1 396 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 KRT37O76014 449 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 FUT4P22083 530 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 FIGNQ5HY92 759 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 SLC5A5Q92911 643 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 SRPK3Q9UPE1 567 aa10.32□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 PRKD3O94806 890 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 SLC6A11P48066 632 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 CYP4F8P98187 520 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 SNX17Q15036 470 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 DDB1Q16531 1140 aa10.31□□□□□ -0.76
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PTPRC-212ENST00000491302 STEAP3Q658P3 488 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 CREB3L3Q68CJ9 461 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 WFDC3Q8IUB2 231 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 LILRA2Q8N149 483 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM8Q9BZR9 551 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 SMOC1Q9H4F8 434 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 PCIF1Q9H4Z3 704 aa10.31□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 E2F8A0AVK6 867 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 MAN2B1O00754 1011 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 HGSO14964 777 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 FBXO21O94952 628 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 NTRK1P04629 796 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 RAC2P15153 192 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 SPINK2P20155 84 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 TACR1P25103 407 aa10.3□□□□□ -0.76
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PTPRC-212ENST00000491302 ARL4AP40617 200 aa10.3□□□□□ -0.76
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PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1958Q8N8K9 716 aa10.3□□□□□ -0.76
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PTPRC-212ENST00000491302 AGBL5Q8NDL9 886 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 CHMP4CQ96CF2 233 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC136Q96JN2 1154 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 AP5M1Q9H0R1 490 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 ACSS2Q9NR19 701 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 ATP23Q9Y6H3 246 aa10.3□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 HPXP02790 462 aa10.29□□□□□ -0.76
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PTPRC-212ENST00000491302 CD97P48960 835 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 GPR158Q5T848 1215 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 BICRALQ6AI39 1079 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 ZBTB46Q86UZ6 589 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 NOSTRINQ8IVI9 506 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 SEC14L1Q92503 715 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 PLCD4Q9BRC7 762 aa10.29□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 NOTOA8MTQ0 251 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 GABRDO14764 452 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 CYP17A1P05093 508 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 MSL3P1P0C860 447 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 GJA4P35212 333 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 PHC1P78364 1004 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 BROXQ5VW32 411 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 TRIM48Q8IWZ4 208 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 ZZZ3Q8IYH5 903 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 SH3RF2Q8TEC5 729 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 YIPF4Q9BSR8 244 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 PCGF6Q9BYE7 350 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 PRDM7Q9NQW5 492 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT5Q9UKK9 219 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 WASHC2AQ641Q2 1341 aa10.28□□□□□ -0.76
PTPRC-212ENST00000491302 SCDO00767 359 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 TGM5O43548 720 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 TADA3O75528 432 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 MED26O95402 600 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 SLC9A1P19634 815 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 SSTR4P31391 388 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 KIF11P52732 1056 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 PPP2R5AQ15172 486 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 KCTD1Q719H9 257 aa10.27□□□□□ -0.77
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PTPRC-212ENST00000491302 KCNH7Q9NS40 1196 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 FBLN5Q9UBX5 448 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF652Q9Y2D9 606 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 FAN1Q9Y2M0 1017 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa10.27□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 KCNK3O14649 394 aa10.26□□□□□ -0.77
PTPRC-212ENST00000491302 PSPNO60542 156 aa10.26□□□□□ -0.77
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