RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa27.79■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 TMEM260Q9NX78 707 aa27.79■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 NOD1Q9Y239 953 aa27.79■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 KAT6AQ92794 2004 aa27.79■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 CYP3A4P08684 503 aa27.78■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 ZNF286BP0CG31 522 aa27.78■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 SCRN1Q12765 414 aa27.78■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 GALNT17Q6IS24 598 aa27.78■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 C16orf70Q9BSU1 422 aa27.78■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.78■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 VPS54Q9P1Q0 977 aa27.78■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 PCDH10Q9P2E7 1040 aa27.78■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa27.78■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 STK36Q9NRP7 1315 aa27.77■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 MEIS1O00470 390 aa27.77■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 SORBS3O60504 671 aa27.77■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 ZNF76P36508 570 aa27.77■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 NLRP5P59047 1200 aa27.77■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 CHMP4BP1P59074 171 aa27.77■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 GPR153Q6NV75 609 aa27.77■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 CCDC155Q8N6L0 562 aa27.77■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 PGBD1Q96JS3 809 aa27.77■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 KCNH7Q9NS40 1196 aa27.77■■■□□ 2.04
EHD1-211ENST00000489379 NFASCO94856 1347 aa27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 H3BRB1 525 aa27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 PITPNM1O00562 1244 aa27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 ATP9AO75110 1047 aa27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 LGALS2P05162 132 aa27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 XBP1P17861 261 aa27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 CYP2C18P33260 490 aa27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 BFSP2Q13515 415 aa27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 SHHQ15465 462 aa27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 PTGISQ16647 500 aa27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 CRYGNQ8WXF5 182 aa27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 ALG1Q9BT22 464 aa27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 BCAS3Q9H6U6 928 aa27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 HDAC6Q9UBN7 1215 aa27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP27.76■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 PPFIA3O75145 1194 aa27.75■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 CAGE1Q8TC20 777 aa27.75■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 SEPT1Q8WYJ6 367 aa27.75■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 SLC34A2O95436 690 aa27.74■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 CYP2C9P11712 490 aa27.74■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 CSF2RAP15509 400 aa27.74■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 RETREG2Q8NC44 543 aa27.74■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 WASF1Q92558 559 aa27.74■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 SDF4Q9BRK5 362 aa27.74■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 IL23AQ9NPF7 189 aa27.74■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 PCDHA4Q9UN74 947 aa27.74■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 SETQ01105 290 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 C9orf50Q5SZB4 431 aa27.73■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 DAGLBQ8NCG7 672 aa27.73■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 IL27Q8NEV9 243 aa27.73■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 PFKMP08237 780 aa27.72■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 RFC2P35250 354 aa27.72■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 EPHB4P54760 987 aa27.72■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 CYP2W1Q8TAV3 490 aa27.72■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 SLC9A2Q9UBY0 812 aa27.72■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 PARNO95453 639 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 GNAT1P11488 350 aa27.71■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 CIITAP33076 1130 aa27.71■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 USP11P51784 963 aa27.71■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 PTK7Q13308 1070 aa27.71■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 ME3Q16798 604 aa27.71■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 PLA2G4DQ86XP0 818 aa27.71■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 BLIDQ8IZY5 108 aa27.71■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 GTF3C6Q969F1 213 aa27.71■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 WNT8AQ9H1J5 351 aa27.71■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 UMODL1Q5DID0 1318 aa27.7■■■□□ 2.03
EHD1-211ENST00000489379 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 ARP10275 920 aa27.7■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 CCL23P55773 120 aa27.7■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 SP4Q02446 784 aa27.7■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 RBL2Q08999 1139 aa27.7■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 TMEM240Q5SV17 173 aa27.7■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 AFAP1L1Q8TED9 768 aa27.7■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa27.7■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP27.7■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 TANC1Q9C0D5 1861 aa27.7■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa27.69■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 FAM86B1E9PN63 330 aa27.69■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 FAM86B2P0C5J1 330 aa27.69■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP27.69■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa27.69■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 PKD2L1Q9P0L9 805 aa27.69■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa27.69■■■□□ 2.02
EHD1-211ENST00000489379 EMSYQ7Z589 1322 aa27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms