RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488923.1

HDLBP-243, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-243ENST00000488923 KCNJ18B7U540 433 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 PIK3CDO00329 1044 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 N4BP3O15049 544 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 NDUFB10O96000 172 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 ASNSP08243 561 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 CCNE1P24864 410 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 POLD1P28340 1107 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 PRCPP42785 496 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 DNM2P50570 870 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 STAT2P52630 851 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 COPB1P53618 953 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 ASIC1P78348 528 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 SKOR1P84550 965 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 LRRC63Q05C16 580 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 PDE4DQ08499 809 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 KCNMA1Q12791 1236 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 KCNJ12Q14500 433 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 TCP11X2Q5H9J9 407 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 POTEAQ6S8J7 498 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 UNC13DQ70J99 1090 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 KCTD1Q719H9 257 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 ZFPM1Q8IX07 1006 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 SAMD3Q8N6K7 520 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 JDP2Q8WYK2 163 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 DPF2Q92785 391 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 HOOK2Q96ED9 719 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 FAM20AQ96MK3 541 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 NUP58Q9BVL2 599 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 CPVLQ9H3G5 476 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM260Q9NX78 707 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 ABCB11O95342 1321 aa7.4□□□□□ -1.22
HDLBP-243ENST00000488923 SLX4Q8IY92 1834 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PSMD14O00487 310 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ADAMTS3O15072 1205 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 GPR37O15354 613 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 KLRC4O43908 158 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 TDP2O95551 362 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 GH2P01242 217 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CCDC175P0C221 793 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 FDX1P10109 184 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 MUTP22033 750 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CIITAP33076 1130 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 SLC16A2P36021 539 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 SREBF1P36956 1147 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PBX1P40424 430 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CACNB3P54284 484 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 MAP3K10Q02779 954 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 TUBB2AQ13885 445 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ARID5BQ14865 1188 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 Q4G0T1 1027 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM119Q4V9L6 283 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CIAPIN1Q6FI81 312 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CCDC65Q8IXS2 484 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 RAD54LQ92698 747 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 P2RX5Q93086 422 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 MED15Q96RN5 788 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 TSG101Q99816 390 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 TUBB2BQ9BVA1 445 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ANO3Q9BYT9 981 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 KCNMB3Q9NPA1 279 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 INTS13Q9NVM9 706 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 FEM1BQ9UK73 627 aa7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 PP2D1A8MPX8 630 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 LGALS16A8MUM7 142 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 TMEM232C9JQI7 657 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CTIFO43310 598 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 RAD21O60216 631 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 MFAP3LO75121 409 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 RAD17O75943 681 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 GNA14O95837 355 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CYP3A4P08684 503 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 BMP1P13497 986 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 DPEP1P16444 411 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CASP1P29466 404 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 CDC25AP30304 524 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 WNT7BP56706 349 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 STX17P56962 302 aa7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 ETF1P62495 437 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HDLBP-243ENST00000488923 TUBB4BP68371 445 aa7.38□□□□□ -1.23
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