RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 ARNTL2Q8WYA1 636 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 MEIS2O14770 477 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 CXCL10P02778 98 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 FANCBQ8NB91 859 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 CDHR1Q96JP9 859 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 EHMT1Q9H9B1 1298 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 RSPH10BP0C881 870 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 SP4Q02446 784 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 SERINC5Q86VE9 423 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 MICU3Q86XE3 530 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 NEK1Q96PY6 1258 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 GPR20Q99678 358 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 KAT6AQ92794 2004 aa23.15■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 LGR5O75473 907 aa23.15■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 TAP1Q03518 808 aa23.15■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.15■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 PTPRSQ13332 1948 aa23.14■■□□□ 1.3
ACTB-212ENST00000484841 GPNMBQ14956 572 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 WNT8BQ93098 351 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 GPRASP2Q96D09 838 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.14■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 RFXAPO00287 272 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 AMHP03971 560 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 DEFB103AP81534 67 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 SEMA3FQ13275 785 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 ASB2Q96Q27 587 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 RAD9AQ99638 391 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 TREHO43280 583 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 CAND2O75155 1236 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 FGD1P98174 961 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 HIC1Q14526 733 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 KRT32Q14532 448 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 AAK1Q2M2I8 961 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 UNC80Q8N2C7 3258 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB43O43298 467 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 CDC45O75419 566 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 GJB5O95377 273 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP4P98171 946 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 MTMR1Q13613 665 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 UBE2SQ16763 222 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 SEPT8Q92599 483 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 SETD4Q9NVD3 440 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 MTCH2Q9Y6C9 303 aa23.11■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 NAPAP54920 295 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 RTN1Q16799 776 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 APOA5Q6Q788 366 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 TRIM50Q86XT4 487 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 CDH23Q9H251 3354 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 MAFGO15525 162 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 CTSHP09668 335 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 MBTPS1Q14703 1052 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 GLG1Q92896 1179 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 INSL6Q9Y581 213 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 NRCAMQ92823 1304 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 EYSQ5T1H1 3165 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 LCHNA4D1U4 455 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 TNFRSF10AO00220 468 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 HOXC8P31273 242 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 ERAP1Q9NZ08 941 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-212ENST00000484841 EPOPA6NHQ4 379 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA8AA7E2F4 631 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA8BA8MQT2 603 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 ATP9AO75110 1047 aa23.07■■□□□ 1.28
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF15O94989 841 aa23.07■■□□□ 1.28
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