RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482651.5

HDGF-208, Transcript of heparin binding growth factor, human

TSL 3

Gene HDGF, Length 966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDGF-208	ENST00000482651	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	PXMP2	Q9NR77	195 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	CYP46A1	Q9Y6A2	500 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	LCT	P09848	1927 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	FSD2	A1L4K1	749 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	ANKRD33B	A6NCL7	494 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	ARIH2	O95376	493 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	TIMP1	P01033	207 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	CD4	P01730	458 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	NR3C2	P08235	984 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	POLR2M	P0CAP2	368 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	CALM1	P0DP23	149 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	CALM2	P0DP24	149 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	CALM3	P0DP25	149 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SMARCA1	P28370	1054 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	FPGS	Q05932	587 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SHH	Q15465	462 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	COPS5	Q92905	334 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SPATA32	Q96LK8	384 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDGF-208	ENST00000482651	GRIN2D	O15399	1336 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	CFAP99	D6REC4	459 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	KPNA6	O60684	536 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	GH1	P01241	217 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	MYL3	P08590	195 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	SCNN1A	P37088	669 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	PSMC6	P62333	389 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	LY6K	Q17RY6	165 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	IER5L	Q5T953	404 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	MFSD5	Q6N075	450 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	SEPT14	Q6ZU15	432 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	MTG1	Q9BT17	334 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	LTBP2	Q14767	1821 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	EPHB4	P54760	987 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	TAGLN	Q01995	201 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	ARHGAP1	Q07960	439 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	10.07	□□□□□ -0.8	4e-14	■■□□□ 13.1
HDGF-208	ENST00000482651	PGM5	Q15124	567 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	ANKRD1	Q15327	319 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	RUFY3	Q7L099	469 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	TMEM199	Q8N511	208 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	SZT2	Q5T011	3432 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	MCM3AP	O60318	1980 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	B4GALT4	O60513	344 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	RGS20	O76081	388 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	MMP3	P08254	477 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	SUPT20HL2	P0C7V6	817 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	RXRA	P19793	462 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	RPS6KB1	P23443	525 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	VAMP1	P23763	118 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	CCND2	P30279	289 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	NR6A1	Q15406	480 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	DEFB123	Q8N688	67 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	FANCB	Q8NB91	859 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	RDH13	Q8NBN7	331 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	IL31RA	Q8NI17	732 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	AFG1L	Q8WV93	481 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	ZDHHC16	Q969W1	377 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	HIPK3	Q9H422	1215 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDGF-208	ENST00000482651	ST18	O60284	1047 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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