RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.59■■□□□ 1.211e-22■■□□□ 11.6
ACTB-210ENST00000477812 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-210ENST00000477812 TELO2Q9Y4R8 837 aa22.59■■□□□ 1.21
ACTB-210ENST00000477812 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-210ENST00000477812 PSMD10O75832 226 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-210ENST00000477812 GH1P01241 217 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-210ENST00000477812 GJB1P08034 283 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-210ENST00000477812 GJA9P57773 515 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-210ENST00000477812 NEDD9Q14511 834 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-210ENST00000477812 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-210ENST00000477812 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
ACTB-210ENST00000477812 FAM20AQ96MK3 541 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-210ENST00000477812 DEFB118Q96PH6 123 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-210ENST00000477812 RIT2Q99578 217 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-210ENST00000477812 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.58■■□□□ 1.21
ACTB-210ENST00000477812 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 CALCRLQ16602 461 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 USP28Q96RU2 1077 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 VAV3Q9UKW4 847 aa22.57■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 MYADML2A6NDP7 307 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 CCNE2O96020 404 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 PGK1P00558 417 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 PTGDRQ13258 359 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 LAMC2Q13753 1193 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 PTPAQ15257 358 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 OR6J1Q8NGC5 347 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 CLIC4Q9Y696 253 aa22.56■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 A6NJR5 290 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 SORBS3O60504 671 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 OR52Z1P0C646 297 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 CST5P28325 142 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 LRCH2Q5VUJ6 765 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 PPTC7Q8NI37 304 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 AFG1LQ8WV93 481 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 SDF4Q9BRK5 362 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.55■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 LAD1O00515 517 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 GAS7O60861 476 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 GJA8P48165 433 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 GPR20Q99678 358 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.54■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 SGPL1O95470 568 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 PPP2R5CQ13362 524 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 ABHD8Q96I13 439 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 SPATA33Q96N06 139 aa22.53■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 BMP15O95972 392 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 MMP3P08254 477 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 PRPHP41219 470 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 ACTR2P61160 394 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 KRT76Q01546 638 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 LRRC41Q15345 812 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 IL17AQ16552 155 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 ATL3Q6DD88 541 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 ELP1O95163 1332 aa22.52■■□□□ 1.2
ACTB-210ENST00000477812 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-210ENST00000477812 ATG7O95352 703 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-210ENST00000477812 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ACTB-210ENST00000477812 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ACTB-210ENST00000477812 BEX3Q00994 111 aa22.51■■□□□ 1.19
ACTB-210ENST00000477812 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ACTB-210ENST00000477812 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ACTB-210ENST00000477812 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ACTB-210ENST00000477812 TXKP42681 527 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-210ENST00000477812 CPT1AP50416 773 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-210ENST00000477812 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.193e-53■■□□□ 12.7
ACTB-210ENST00000477812 SP4Q02446 784 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-210ENST00000477812 SLC39A14Q15043 492 aa22.5■■□□□ 1.19
ACTB-210ENST00000477812 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
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