RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477464.1

SAR1A-208, Transcript of secretion associated Ras related GTPase 1A, humanhuman

TSL 2

Gene SAR1A, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAR1A-208ENST00000477464 SLC12A9Q9BXP2 914 aa6.28□□□□□ -1.4
SAR1A-208ENST00000477464 HDAC8Q9BY41 377 aa6.28□□□□□ -1.4
SAR1A-208ENST00000477464 FAM204AQ9H8W3 233 aa6.28□□□□□ -1.4
SAR1A-208ENST00000477464 SP110Q9HB58 689 aa6.28□□□□□ -1.4
SAR1A-208ENST00000477464 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.28□□□□□ -1.4
SAR1A-208ENST00000477464 PLCB1Q9NQ66 1216 aa6.28□□□□□ -1.4
SAR1A-208ENST00000477464 CLDND1Q9NY35 253 aa6.28□□□□□ -1.4
SAR1A-208ENST00000477464 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SAR1A-208ENST00000477464 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa6.28□□□□□ -1.4
SAR1A-208ENST00000477464 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa6.28□□□□□ -1.4
SAR1A-208ENST00000477464 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa6.28□□□□□ -1.4
SAR1A-208ENST00000477464 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa6.28□□□□□ -1.4
SAR1A-208ENST00000477464 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.28□□□□□ -1.4
SAR1A-208ENST00000477464 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.28□□□□□ -1.4
SAR1A-208ENST00000477464 TRIM75PA6NK02 468 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 F8W735 103 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 ARNTLO00327 626 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 WNT9AO14904 365 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 ALX3O95076 343 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 SYPP08247 313 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 MYBP10242 640 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 GNAT1P11488 350 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 PDE6AP16499 860 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 AKAP5P24588 427 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 KIF11P52732 1056 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 AK2P54819 239 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 LMOD3Q0VAK6 560 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 STK3Q13188 491 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 NFKBIBQ15653 356 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 INF2Q27J81 1249 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 SGO2Q562F6 1265 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 SRLQ86TD4 932 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 FAM186BQ8IYM0 893 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 CPXCR1Q8N123 301 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 SLC35G2Q8TBE7 412 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 GJA10Q969M2 543 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 RUNDC1Q96C34 613 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 SCLT1Q96NL6 688 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 MYD88Q99836 296 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 CDADC1Q9BWV3 514 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 USP21Q9UK80 565 aa6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 GNAT3A8MTJ3 354 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 KCNK3O14649 394 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 FGAP02671 866 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 ELNP15502 786 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 CD53P19397 219 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 SERPINB3P29508 390 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 GTF2A2P52657 109 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 GJA9P57773 515 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 PHC1P78364 1004 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 ZNF267Q14586 743 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 LONRF1Q17RB8 773 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 ERAP2Q6P179 960 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 CCDC149Q6ZUS6 474 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 FRMD7Q6ZUT3 714 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 OSTM1Q86WC4 334 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 CAMKK1Q8N5S9 505 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 LMBR1Q8WVP7 490 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 PLVAPQ9BX97 442 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 KCNG1Q9UIX4 513 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 DMTF1Q9Y222 760 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.26□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.25□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.25□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 FKTNO75072 461 aa6.25□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 LEFTY1O75610 366 aa6.25□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 TBC1D8O95759 1140 aa6.25□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 FAM87AP0C7U9 286 aa6.25□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 CD40P25942 277 aa6.25□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 BCL6P41182 706 aa6.25□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 GPR3P46089 330 aa6.25□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 JAM2P57087 298 aa6.25□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
SAR1A-208ENST00000477464 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.25□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms