RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 CYP4F22Q6NT55 531 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 MILR1Q7Z6M3 343 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.75□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP6.75□□□□□ -1.33
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PRPF40A-208ENST00000472760 IL2P60568 153 aa6.74□□□□□ -1.33
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PRPF40A-208ENST00000472760 CD244Q9BZW8 370 aa6.74□□□□□ -1.33
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PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF652Q9Y2D9 606 aa6.73□□□□□ -1.33
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PRPF40A-208ENST00000472760 H7C1D1 291 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 MAN2B1O00754 1011 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 ABLIM1O14639 778 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 ZEB2O60315 1214 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 HIP1RO75146 1068 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 MAPKAPK2P49137 400 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 PRR5P85299 388 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 IRF9Q00978 393 aa6.72□□□□□ -1.33
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PRPF40A-208ENST00000472760 MPZL3Q6UWV2 235 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 KCTD1Q719H9 257 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.72□□□□□ -1.33
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PRPF40A-208ENST00000472760 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 ASH2LQ9UBL3 628 aa6.72□□□□□ -1.33
PRPF40A-208ENST00000472760 TCRBV5S2A0A599 114 aa6.71□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 FKBP9O95302 570 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 EYA4O95677 639 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 BPIP17213 487 aa6.71□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 IRAK1P51617 712 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 EVA1CP58658 441 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 TUSC3Q13454 348 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF174Q15697 407 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 FIGNQ5HY92 759 aa6.71□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.71□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 NEMP1O14524 444 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 PAPLNO95428 1278 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 LTFP02788 710 aa6.7□□□□□ -1.34
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PRPF40A-208ENST00000472760 LSSP48449 732 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 STAT4Q14765 748 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 CPZQ66K79 652 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 PASD1Q8IV76 773 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 Q8N3U1 123 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 HOMER2Q9NSB8 354 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 OXSMQ9NWU1 459 aa6.7□□□□□ -1.34
PRPF40A-208ENST00000472760 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
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