RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470356.3

HMG20B-209, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HMG20B, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-209ENST00000470356 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa36.03■■■■□ 3.36
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HMG20B-209ENST00000470356 CCDC82Q8N4S0 544 aa36.03■■■■□ 3.36
HMG20B-209ENST00000470356 WNT8BQ93098 351 aa36.03■■■■□ 3.36
HMG20B-209ENST00000470356 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa36.02■■■■□ 3.36
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HMG20B-209ENST00000470356 HOXC8P31273 242 aa36.02■■■■□ 3.36
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HMG20B-209ENST00000470356 NLRX1Q86UT6 975 aa36.02■■■■□ 3.36
HMG20B-209ENST00000470356 GPR20Q99678 358 aa36.02■■■■□ 3.36
HMG20B-209ENST00000470356 TRANK1O15050 2925 aa36.02■■■■□ 3.36
HMG20B-209ENST00000470356 KIF28PB7ZC32 967 aa36.01■■■■□ 3.36
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HMG20B-209ENST00000470356 KCNJ6P48051 423 aa36.01■■■■□ 3.36
HMG20B-209ENST00000470356 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP36.01■■■■□ 3.36
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HMG20B-209ENST00000470356 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa35.99■■■■□ 3.35
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HMG20B-209ENST00000470356 EFCAB14O75071 495 aa35.96■■■■□ 3.35
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HMG20B-209ENST00000470356 ITGB5P18084 799 aa35.95■■■■□ 3.35
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HMG20B-209ENST00000470356 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP35.95■■■■□ 3.35
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HMG20B-209ENST00000470356 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa35.94■■■■□ 3.34
HMG20B-209ENST00000470356 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa35.94■■■■□ 3.34
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HMG20B-209ENST00000470356 DEFB103AP81534 67 aa35.93■■■■□ 3.34
HMG20B-209ENST00000470356 SP4Q02446 784 aa35.93■■■■□ 3.34
HMG20B-209ENST00000470356 FUT2Q10981 343 aa35.93■■■■□ 3.34
HMG20B-209ENST00000470356 RTN1Q16799 776 aa35.93■■■■□ 3.34
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HMG20B-209ENST00000470356 MAFGO15525 162 aa35.91■■■■□ 3.34
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HMG20B-209ENST00000470356 MTMR1Q13613 665 aa35.9■■■■□ 3.34
HMG20B-209ENST00000470356 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
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HMG20B-209ENST00000470356 GJB5O95377 273 aa35.89■■■■□ 3.34
HMG20B-209ENST00000470356 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP35.89■■■■□ 3.34
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HMG20B-209ENST00000470356 PPP1R18Q6NYC8 613 aa35.89■■■■□ 3.34
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HMG20B-209ENST00000470356 JADE2Q9NQC1 790 aa35.89■■■■□ 3.34
HMG20B-209ENST00000470356 THEGQ9P2T0 379 aa35.89■■■■□ 3.34
HMG20B-209ENST00000470356 MICAL3Q7RTP6 2002 aa35.89■■■■□ 3.34
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