RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
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SH3BP1-206ENST00000469947 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-206ENST00000469947 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.87□□□□□ -0.03
SH3BP1-206ENST00000469947 LRP5O75197 1615 aa14.87□□□□□ -0.03
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SH3BP1-206ENST00000469947 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.03
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SH3BP1-206ENST00000469947 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa14.83□□□□□ -0.03
SH3BP1-206ENST00000469947 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.83□□□□□ -0.03
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SH3BP1-206ENST00000469947 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.83□□□□□ -0.03
SH3BP1-206ENST00000469947 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-206ENST00000469947 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-206ENST00000469947 SART1O43290 800 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-206ENST00000469947 MYBP10242 640 aa14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-206ENST00000469947 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SH3BP1-206ENST00000469947 SLC18A3Q16572 532 aa14.83□□□□□ -0.04
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