RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 CEP55Q53EZ4 464 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 MFSD5Q6N075 450 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 KAT2BQ92831 832 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 C22orf23Q9BZE7 217 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 HIPK3Q9H422 1215 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 STK36Q9NRP7 1315 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 NOD1Q9Y239 953 aa16.83■□□□□ 0.28
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SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM199Q8N511 208 aa16.82■□□□□ 0.28
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SH3BP1-205ENST00000466097 ALG1Q9BT22 464 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP16.82■□□□□ 0.28
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SH3BP1-205ENST00000466097 GTF3C6Q969F1 213 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 GPR20Q99678 358 aa16.81■□□□□ 0.28
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SH3BP1-205ENST00000466097 BCAS3Q9H6U6 928 aa16.81■□□□□ 0.28
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SH3BP1-205ENST00000466097 SCN5AQ14524 2016 aa16.8■□□□□ 0.28
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SH3BP1-205ENST00000466097 CYP2C18P33260 490 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP1-205ENST00000466097 SETQ01105 290 aaPredicted RBP16.79■□□□□ 0.28
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SH3BP1-205ENST00000466097 HDAC6Q9UBN7 1215 aa16.79■□□□□ 0.28
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SH3BP1-205ENST00000466097 FAM86B2P0C5J1 330 aa16.77■□□□□ 0.28
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SH3BP1-205ENST00000466097 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
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SH3BP1-205ENST00000466097 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP16.76■□□□□ 0.27
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SH3BP1-205ENST00000466097 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP16.76■□□□□ 0.27
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