RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461648.2

TSC2-208, Transcript of TSC complex subunit 2, human

TSL 2

Gene TSC2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC2-208	ENST00000461648	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
TSC2-208	ENST00000461648	MSH4	O15457	936 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TSC2-208	ENST00000461648	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
TSC2-208	ENST00000461648	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
TSC2-208	ENST00000461648	SOX10	P56693	466 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TSC2-208	ENST00000461648	BEX3	Q00994	111 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TSC2-208	ENST00000461648	REST	Q13127	1097 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TSC2-208	ENST00000461648	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
TSC2-208	ENST00000461648	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TSC2-208	ENST00000461648	TTC38	Q5R3I4	469 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TSC2-208	ENST00000461648	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TSC2-208	ENST00000461648	SPATA33	Q96N06	139 aa		28.89	■■■□□ 2.22
TSC2-208	ENST00000461648	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
TSC2-208	ENST00000461648	CPT1A	P50416	773 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	AFG1L	Q8WV93	481 aa		28.88	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648		A6NJR5	290 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	KBTBD13	C9JR72	458 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	DNM1L	O00429	736 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	POTED	Q86YR6	584 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	PPTC7	Q8NI37	304 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	SLC5A5	Q92911	643 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		28.87	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	ZEB2	O60315	1214 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	NEMF	O60524	1076 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	MCM7	P33993	719 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF174	Q15697	407 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		28.86	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	TBX3	O15119	743 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	MMP3	P08254	477 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	SP4	Q02446	784 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	PKP1	Q13835	747 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	NBR1	Q14596	966 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	KCNA10	Q16322	511 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	FAM20A	Q96MK3	541 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	RIT2	Q99578	217 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		28.85	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	28.84	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	MARCH6	O60337	910 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	CALCRL	Q16602	461 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	GJA10	Q969M2	543 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	GPR20	Q99678	358 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		28.84	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	GAS7	O60861	476 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	HAS1	Q92839	578 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	PHF24	Q9UPV7	400 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		28.83	■■■□□ 2.21
TSC2-208	ENST00000461648	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	KPNA6	O60684	536 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	PSMD10	O75832	226 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	ASGR1	P07306	291 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	MYL3	P08590	195 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	ACLY	P53396	1101 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	DGKD	Q16760	1214 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		28.82	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	PPFIA4	O75335	1185 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	F13A1	P00488	732 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	28.81	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	KRT76	Q01546	638 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		28.81	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	ELP1	O95163	1332 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	CCNE2	O96020	404 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	ACTR2	P61160	394 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	MTMR9	Q96QG7	549 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	BRCA2	P51587	3418 aa		28.8	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	BRD1	O95696	1058 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	28.79	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		28.79	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648		A0A1W2PQY0	241 aa		28.78	■■■□□ 2.2
TSC2-208	ENST00000461648	CABYR	O75952	493 aa		28.78	■■■□□ 2.2

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