RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453410.1

C9orf135-AS1-202, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C9orf135-AS1, Length 975 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 USP11P51784 963 aa12.82□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARHGAP4P98171 946 aa12.82□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DGKDQ16760 1214 aa12.82□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NFRKBQ6P4R8 1299 aa12.82□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NECAB1Q8N987 351 aa12.82□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYP2W1Q8TAV3 490 aa12.82□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C16orf70Q9BSU1 422 aa12.82□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PDLIM7Q9NR12 457 aa12.82□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCNH7Q9NS40 1196 aa12.82□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NFASCO94856 1347 aa12.82□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 A0A1W2PPC1 479 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIM43BA6NCK2 446 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPFIA3O75145 1194 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CD44P16070 742 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYP3A7P24462 503 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HOXC8P31273 242 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MTMR1Q13613 665 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 C7orf61Q8IZ16 206 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 BLIDQ8IZY5 108 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 WASF1Q92558 559 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SPATA33Q96N06 139 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MBOAT7Q96N66 472 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AIFM3Q96NN9 605 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GPR20Q99678 358 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa12.81□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DCDC2CA8MYV0 355 aa12.8□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM86B1E9PN63 330 aa12.8□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 DHX15O43143 795 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ATG7O95352 703 aa12.8□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CLTBP09497 229 aa12.8□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 FAM86B2P0C5J1 330 aa12.8□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NLRP5P59047 1200 aa12.8□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 NBPF20Q3BBV1 942 aa12.8□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MOXD1Q6UVY6 613 aa12.8□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CYFIP1Q7L576 1253 aa12.8□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa12.8□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LENG9Q96B70 501 aa12.8□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MLXIPQ9HAP2 919 aa12.8□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa12.79□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYL3P08590 195 aa12.79□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ARP10275 920 aa12.79□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ITGB8P26012 769 aa12.79□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MCM2P49736 904 aa12.79□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TNFRSF25Q93038 417 aa12.79□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PGBD1Q96JS3 809 aa12.79□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CTAGE1Q96RT6 745 aa12.79□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MYH7BA7E2Y1 1941 aa12.79□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa12.79□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ST18O60284 1047 aa12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LGR5O75473 907 aa12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TIMP1P01033 207 aa12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 XBP1P17861 261 aa12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PSMC6P62333 389 aa12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 Q4G0T1 1027 aa12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KRT25Q7Z3Z0 450 aa12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RASGRP4Q8TDF6 673 aa12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SEPT1Q8WYJ6 367 aa12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 VTI1AQ96AJ9 217 aa12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ALG1Q9BT22 464 aa12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KATNAL1Q9BW62 490 aa12.78□□□□□ -0.36
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 H3BRB1 525 aa12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TLR3O15455 904 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 JAK2O60674 1132 aa12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 ADAM17P78536 824 aa12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SETQ01105 290 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 RBL2Q08999 1139 aa12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 PPP4R3AQ6IN85 833 aa12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 B3GNT9Q6UX72 402 aa12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TBCKQ8TEA7 893 aa12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TRPV6Q9H1D0 765 aa12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 GJB4Q9NTQ9 266 aa12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TBC1D22BQ9NU19 505 aa12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TMEM39AQ9NV64 488 aa12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 KCNJ14Q9UNX9 436 aa12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 TELO2Q9Y4R8 837 aa12.77□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LTBP2Q14767 1821 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 B4GALT4O60513 344 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 MMP1P03956 469 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 LGALS2P05162 132 aa12.76□□□□□ -0.37
C9orf135-AS1-202ENST00000453410 SYN1P17600 705 aa12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms