RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		15.5	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		15.5	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	GJB1	P08034	283 aa		15.49	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	DDIT3	P35638	169 aa		15.49	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	ITGB3BP	Q13352	177 aa	Predicted RBP	15.49	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	LAMC2	Q13753	1193 aa		15.49	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		15.49	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	TCEAL9	Q9UHQ7	104 aa		15.49	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402		Q9Y3F1	56 aa		15.49	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		15.49	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	GAS7	O60861	476 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	SGPL1	O95470	568 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	TXK	P42681	527 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	BEX3	Q00994	111 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARHGAP1	Q07960	439 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTGDR	Q13258	359 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	METTL7B	Q6UX53	244 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLFN12	Q8IYM2	578 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	AFG1L	Q8WV93	481 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABHD8	Q96I13	439 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	FAM20A	Q96MK3	541 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHMP2A	O43633	222 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	GJA9	P57773	515 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	RNF180	Q86T96	592 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	HAS1	Q92839	578 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC5A5	Q92911	643 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	CLIC4	Q9Y696	253 aa		15.48	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	NFASC	O94856	1347 aa		15.47	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYADML2	A6NDP7	307 aa		15.47	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		15.47	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBX3	O15119	743 aa		15.47	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	CPT1A	P50416	773 aa		15.47	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	15.47	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	RIT2	Q99578	217 aa		15.47	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	15.47	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	SAMM50	Q9Y512	469 aa		15.47	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	POTEF	A5A3E0	1075 aa		15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZEB2	O60315	1214 aa		15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADAMTS4	O75173	837 aa		15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	PSMD10	O75832	226 aa		15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR52Z1	P0C646	297 aa		15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	GJA8	P48165	433 aa		15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRRC41	Q15345	812 aa		15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPTC7	Q8NI37	304 aa		15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	MTMR9	Q96QG7	549 aa		15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	USP28	Q96RU2	1077 aa		15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHMP5	Q9NZZ3	219 aa		15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		15.46	■□□□□ 0.07
SELENBP1-208	ENST00000447402	KBTBD13	C9JR72	458 aa		15.45	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	LAD1	O00515	517 aa		15.45	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	MYL3	P08590	195 aa		15.45	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	TEC	P42680	631 aa		15.45	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHMP4BP1	P59074	171 aa		15.45	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	KRT76	Q01546	638 aa		15.45	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	15.45	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNA10	Q16322	511 aa		15.45	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	DGKD	Q16760	1214 aa		15.45	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		15.45	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		15.45	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR20	Q99678	358 aa		15.45	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		15.45	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		15.45	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		15.45	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402		A6NJR5	290 aa		15.44	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	BMP15	O95972	392 aa		15.44	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	CCNE2	O96020	404 aa		15.44	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	MMP3	P08254	477 aa		15.44	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	TCF7	P36402	384 aa	Predicted RBP	15.44	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACTR2	P61160	394 aa		15.44	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	STK38	Q15208	465 aa		15.44	■□□□□ 0.06
SELENBP1-208	ENST00000447402	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		15.44	■□□□□ 0.06

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