RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436673.5

UPP1-208, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene UPP1, Length 918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-208ENST00000436673 NEDD9Q14511 834 aa30.5■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 USP17L6PQ6QN14 398 aa30.5■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 LZTS2Q9BRK4 669 aa30.5■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP30.5■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 PIK3CDO00329 1044 aa30.49■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 NOP56O00567 594 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 LGR5O75473 907 aa30.49■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 GJB5O95377 273 aa30.49■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa30.49■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa30.49■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 THPOP40225 353 aa30.49■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 KRT40Q6A162 431 aa30.49■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 CYFIP1Q7L576 1253 aa30.49■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa30.49■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 ATP6V0A1Q93050 837 aa30.49■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 USP26Q9BXU7 913 aa30.49■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 EMSYQ7Z589 1322 aa30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 MEIS2O14770 477 aa30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 MCM5P33992 734 aa30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 GNAQP50148 359 aa30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 GRB10Q13322 594 aa30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 PCNX4Q63HM2 1172 aa30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 XRRA1Q6P2D8 792 aa30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 TMTC2Q8N394 836 aa30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 IL27Q8NEV9 243 aa30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 CUL5Q93034 780 aa30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 TMEM87BQ96K49 555 aa30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 RAD9AQ99638 391 aa30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 GPR20Q99678 358 aa30.48■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 RSPH10B2B2RC85 870 aa30.47■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 PLEKHA8P1O95397 391 aa30.47■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 RSPH10BP0C881 870 aa30.47■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 TFF2Q03403 129 aa30.47■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 NFXL1Q6ZNB6 911 aa30.47■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP30.47■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 SLC27A2O14975 620 aa30.46■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 TREHO43280 583 aa30.46■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 LPXNO60711 386 aa30.46■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 RNPEPQ9H4A4 650 aa30.46■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 CCDC69A6NI79 296 aa30.45■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 LIFRP42702 1097 aa30.45■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP30.45■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 DBF4BQ8NFT6 615 aa30.45■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 SENP7Q9BQF6 1050 aa30.45■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa30.45■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 TELO2Q9Y4R8 837 aa30.45■■■□□ 2.47
UPP1-208ENST00000436673 BMP1P13497 986 aa30.44■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 RXRAP19793 462 aa30.44■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 AAK1Q2M2I8 961 aa30.44■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP30.44■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 TRIM50Q86XT4 487 aa30.44■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP30.44■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 BDP1A6H8Y1 2624 aa30.43■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 CALM1P0DP23 149 aa30.43■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 CALM2P0DP24 149 aa30.43■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 CALM3P0DP25 149 aa30.43■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 NECTIN1Q15223 517 aa30.43■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa30.43■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 CREB3L3Q68CJ9 461 aa30.43■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 LINC01553A4QN01 128 aa30.42■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 CAND2O75155 1236 aa30.42■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 GNAT1P11488 350 aa30.42■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 ERVK-21P61565 698 aa30.42■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 FAM117BQ6P1L5 589 aa30.42■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 NLRX1Q86UT6 975 aa30.42■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 PSTPIP2Q9H939 334 aa30.42■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 SETD4Q9NVD3 440 aa30.42■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 GDPD5Q8WTR4 605 aa30.41■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP30.41■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 COG5Q9UP83 839 aa30.41■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 NCOR1O75376 2440 aa30.4■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 AMHP03971 560 aa30.4■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 KCNQ1P51787 676 aa30.4■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 ADAM17P78536 824 aa30.4■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 SP4Q02446 784 aa30.4■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 SUGCTQ9HAC7 445 aa30.4■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 LMCD1Q9NZU5 365 aa30.4■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 INSL6Q9Y581 213 aa30.4■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 SLC12A7Q9Y666 1083 aa30.4■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa30.39■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 GPRASP2Q96D09 838 aa30.39■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 LRRC2Q9BYS8 371 aa30.39■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 OSBPL7Q9BZF2 842 aa30.39■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 ANO2Q9NQ90 1003 aa30.39■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 MTUS1Q9ULD2 1270 aa30.39■■■□□ 2.46
UPP1-208ENST00000436673 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa30.38■■■□□ 2.45
UPP1-208ENST00000436673 CTSHP09668 335 aa30.38■■■□□ 2.45
UPP1-208ENST00000436673 KCNA2P16389 499 aa30.38■■■□□ 2.45
UPP1-208ENST00000436673 ITGB5P18084 799 aa30.38■■■□□ 2.45
UPP1-208ENST00000436673 TMTC3Q6ZXV5 915 aa30.38■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms