RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 MICU3Q86XE3 530 aa23.16■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.16■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 RASEFQ8IZ41 740 aa23.16■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 NEK1Q96PY6 1258 aa23.16■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 GPR20Q99678 358 aa23.16■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.16■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 WDR5P61964 334 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 RNF20Q5VTR2 975 aa23.15■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.15■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 APOA5Q6Q788 366 aa23.15■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 SERINC5Q86VE9 423 aa23.15■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.15■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 REV3LO60673 3130 aa23.15■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa23.14■■□□□ 1.3
HLA-B-250ENST00000434333 UBE2SQ16763 222 aa23.14■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.14■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.14■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 CNKSR3Q6P9H4 555 aa23.14■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.14■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.14■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.14■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 TRANK1O15050 2925 aa23.13■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.13■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.13■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 IGFBP4P22692 258 aa23.13■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 DEFB103AP81534 67 aa23.13■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 TRIM50Q86XT4 487 aa23.13■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 PPM1EQ8WY54 764 aa23.13■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 USP26Q9BXU7 913 aa23.13■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 BRPF3Q9ULD4 1205 aa23.13■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 C17orf102A2RUQ5 167 aa23.12■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 CDC45O75419 566 aa23.12■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 TAP1Q03518 808 aa23.12■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 FUT2Q10981 343 aa23.12■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.12■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 EPOPA6NHQ4 379 aa23.11■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 TREHO43280 583 aa23.11■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 ATP9AO75110 1047 aa23.11■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 KCNA2P16389 499 aa23.11■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 ITGB5P18084 799 aa23.11■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 KCNJ6P48051 423 aa23.11■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.11■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 NLRX1Q86UT6 975 aa23.11■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.11■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 GPRASP2Q96D09 838 aa23.11■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa23.11■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 RFXAPO00287 272 aa23.1■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP23.1■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 WWC2Q6AWC2 1192 aa23.1■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa23.1■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 SPRED2Q7Z698 418 aa23.1■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 CERS4Q9HA82 394 aa23.1■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.1■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.1■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa23.09■■□□□ 1.29
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HLA-B-250ENST00000434333 KIF28PB7ZC32 967 aa23.09■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 THPOP40225 353 aa23.09■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 ADAM17P78536 824 aa23.09■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 SP4Q02446 784 aa23.09■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.09■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.08■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 TLL1O43897 1013 aa23.08■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 LGR5O75473 907 aa23.08■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 RSPH10BP0C881 870 aa23.08■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 RTN1Q16799 776 aa23.08■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 OSBPL7Q9BZF2 842 aa23.08■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 SETD4Q9NVD3 440 aa23.08■■□□□ 1.29
HLA-B-250ENST00000434333 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.08■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.07■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 ZBTB43O43298 467 aa23.07■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 TJAP1Q5JTD0 557 aa23.07■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.07■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 KCNB2Q92953 911 aa23.07■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 CDHR1Q96JP9 859 aa23.07■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 JADE2Q9NQC1 790 aa23.07■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 THEGQ9P2T0 379 aa23.07■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 MUC3AQ02505 3323 aa23.07■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 EMSYQ7Z589 1322 aa23.07■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa23.06■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 EFCAB14O75071 495 aa23.06■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 GJB5O95377 273 aa23.06■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 CDC27P30260 824 aa23.06■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 MTMR1Q13613 665 aa23.06■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 IKBKEQ14164 716 aa23.06■■□□□ 1.28
HLA-B-250ENST00000434333 KRT32Q14532 448 aa23.06■■□□□ 1.28
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