RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433927.1

ELL3-202, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

TSL 5

Gene ELL3, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-202ENST00000433927 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.41■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 METTL7BQ6UX53 244 aa23.41■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.41■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 LY9Q9HBG7 655 aa23.41■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 REV3LO60673 3130 aa23.41■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 RSPH10B2B2RC85 870 aa23.4■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 FIBPO43427 364 aa23.4■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 RSPH10BP0C881 870 aa23.4■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 MCM5P33992 734 aa23.4■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 HIC1Q14526 733 aa23.4■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.4■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.4■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.4■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.4■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 COG5Q9UP83 839 aa23.4■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 NCOR1O75376 2440 aa23.4■■□□□ 1.34
ELL3-202ENST00000433927 LCHNA4D1U4 455 aa23.39■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 PIK3CDO00329 1044 aa23.39■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 PRC1O43663 620 aa23.39■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa23.39■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa23.39■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 GNAT1P11488 350 aa23.39■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 GRB10Q13322 594 aa23.39■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 MBTPS1Q14703 1052 aa23.39■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 TMEM87BQ96K49 555 aa23.39■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 MYL10Q9BUA6 226 aa23.39■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 CCDC69A6NI79 296 aa23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 HOXC8P31273 242 aa23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 TFF2Q03403 129 aa23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 TCTN1Q2MV58 587 aa23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 KRT40Q6A162 431 aa23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 NLRX1Q86UT6 975 aa23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 GPR20Q99678 358 aa23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 RNPEPQ9H4A4 650 aa23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 LMCD1Q9NZU5 365 aa23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 CAND2O75155 1236 aa23.37■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 AMHP03971 560 aa23.37■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 CALM1P0DP23 149 aa23.37■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 CALM2P0DP24 149 aa23.37■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 CALM3P0DP25 149 aa23.37■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 BMP1P13497 986 aa23.37■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 SEMA3FQ13275 785 aa23.37■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 DOCK5Q9H7D0 1870 aa23.36■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 MEIS2O14770 477 aa23.36■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 TREHO43280 583 aa23.36■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 FAM117BQ6P1L5 589 aa23.36■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 DBF4BQ8NFT6 615 aa23.36■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 INSL6Q9Y581 213 aa23.36■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 KAT6AQ92794 2004 aa23.36■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 LPXNO60711 386 aa23.35■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 LIFRP42702 1097 aa23.35■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 ERVK-21P61565 698 aa23.35■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa23.35■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 SPRED2Q7Z698 418 aa23.35■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 SEPT8Q92599 483 aa23.35■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 HLA-CQ95604 372 aa23.35■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 CDHR1Q96JP9 859 aa23.35■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.35■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.35■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 LINC01553A4QN01 128 aa23.34■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.34■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 MYOCDQ8IZQ8 938 aa23.34■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 GDPD5Q8WTR4 605 aa23.34■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 SETD4Q9NVD3 440 aa23.34■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 MTUS1Q9ULD2 1270 aa23.34■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.34■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 SLC27A2O14975 620 aa23.33■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 KCNQ1P51787 676 aa23.33■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 SP4Q02446 784 aa23.33■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 GPRASP2Q96D09 838 aa23.33■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.33■■□□□ 1.33
ELL3-202ENST00000433927 SIP14410 1827 aa23.32■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 CTSHP09668 335 aa23.32■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 TRIM50Q86XT4 487 aa23.32■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.32■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 RXRAP19793 462 aa23.31■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 ARHGAP4P98171 946 aa23.31■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.31■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 ANO2Q9NQ90 1003 aa23.31■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 NRCAMQ92823 1304 aa23.31■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.3■■□□□ 1.32
ELL3-202ENST00000433927 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms