RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431283.1

PTPN4-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, human

TSL 3

Gene PTPN4, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN4-204	ENST00000431283	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PTPN4-204	ENST00000431283	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC6A20	Q9NP91	592 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PTPN4-204	ENST00000431283	GNAT1	P11488	350 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	INSRR	P14616	1297 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF28	P17035	718 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	VASN	Q6EMK4	673 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	NSMF	Q6X4W1	530 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	GML	Q99445	158 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	KLF4	O43474	513 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	LRG1	P02750	347 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	FGFR1	P11362	822 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	PABPC1	P11940	636 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	GRK2	P25098	689 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	GRK3	P35626	688 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	GGN	Q86UU5	652 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	SAMD11	Q96NU1	681 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	KCNJ15	Q99712	375 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	JADE2	Q9NQC1	790 aa		7.38	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	SLC27A2	O14975	620 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	LAMTOR5	O43504	91 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	MSC	O60682	206 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	FBXO21	O94952	628 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	CAPNS1	P04632	268 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	7.37	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	LBX2	Q6XYB7	198 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	ALG1	Q9BT22	464 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		7.37	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	GPR85	P60893	370 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	GRIN1	Q05586	938 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	RAB33A	Q14088	237 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	RBM15	Q96T37	977 aa	Known RBP eCLIP	7.36	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	7.35	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	KRTAP10-2	P60368	255 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	PUM2	Q8TB72	1066 aa	Known RBP eCLIP	7.35	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	C8orf49	Q96NF6	230 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	CDIP1	Q9H305	208 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	DLL4	Q9NR61	685 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		7.35	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283		E9PSI1	815 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	COL6A2	P12110	1019 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	ADAM17	P78536	824 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	TUSC3	Q13454	348 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	CPZ	Q66K79	652 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	STYK1	Q6J9G0	422 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	KBTBD2	Q8IY47	623 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	CDC6	Q99741	560 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	DSE	Q9UL01	958 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PTPN4-204	ENST00000431283	B4GALT3	O60512	393 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	SOD2	P04179	222 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	KISS1R	Q969F8	398 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	OSBP2	Q969R2	916 aa		7.33	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	BLACE	A4D250	179 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	APP	P05067	770 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	FAH	P16930	419 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	PNPLA5	Q7Z6Z6	429 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		7.32	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	B4GALT4	O60513	344 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	CHGB	P05060	677 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	CKM	P06732	381 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	PPP2CB	P62714	309 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	PPP2CA	P67775	309 aa		7.31	□□□□□ -1.24
PTPN4-204	ENST00000431283	NFATC3	Q12968	1075 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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