RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FOXQ1Q9C009 403 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SCUBE2Q9NQ36 999 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGEF3Q9NR81 526 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A6NJR5 290 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ENO4A6NNW6 628 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GIPC1O14908 333 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATP2A1O14983 1001 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BAG3O95817 575 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SHMT1P34896 483 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATP2B3Q16720 1220 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC102BQ68D86 513 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLHDC4Q8TBB5 520 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WNT8BQ93098 351 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMX2Q9Y320 296 aa10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAD50Q92878 1312 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ACACAQ13085 2346 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MAGEA9P43362 315 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KCNC4Q03721 635 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LLGL2Q6P1M3 1020 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATG9AQ7Z3C6 839 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHST13Q8NET6 341 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYL10Q9BUA6 226 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTC3P53804 2025 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RSPH10B2B2RC85 870 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FSCN2O14926 492 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RSPH10BP0C881 870 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SRFP11831 508 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EEPD1Q7L9B9 569 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SH2D4AQ9H788 454 aa10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FBN2P35556 2912 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 STARD6P59095 220 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OTOP3Q7RTS5 596 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 APBB2Q92870 758 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WDR11Q9BZH6 1224 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EYA2O00167 538 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEC24BO95487 1268 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATAT1Q5SQI0 421 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSSK4Q6SA08 328 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPR20Q99678 358 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IFT57Q9NWB7 429 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CREBBPQ92793 2442 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TREHO43280 583 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DGKIO75912 1065 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 WEE2P0C1S8 567 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CHMP4BP1P59074 171 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ERVFC1P60507 584 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SIAH1Q8IUQ4 282 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TSPYL6Q8N831 410 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GPR152Q8TDT2 470 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MORC4Q8TE76 937 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 COL12A1Q99715 3063 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 OSBPL6Q9BZF3 934 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BCAS3Q9H6U6 928 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAI14Q9P0K7 980 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM221BA6H8Z2 402 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NRLP54845 237 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GNAI1P63096 354 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKRD44Q8N8A2 993 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KLK13Q9UKR3 277 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LCTP09848 1927 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TDGF1P13385 188 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC4A3P48751 1232 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM179Q6ZVK1 233 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AFG1LQ8WV93 481 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SHDQ96IW2 340 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HDAC6Q9UBN7 1215 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NOTCH2Q04721 2471 aa10.41□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 APC2O95996 2303 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF806P0C7X5 589 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADORA1P30542 326 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RASGRP2Q7LDG7 609 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TTC6Q86TZ1 520 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CPXCR1Q8N123 301 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC44A3Q8N4M1 653 aa10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms