RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SNX14Q9Y5W7 946 aa15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 V9GY48 417 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 hCG_1984214I3L0E3 225 aa15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PARNO95453 639 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LGALS2P05162 132 aa15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CPA1P15085 419 aa15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SELPP16109 830 aa15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PSMA5P28066 241 aa15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NAPAP54920 295 aa15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RBL2Q08999 1139 aa15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PTK7Q13308 1070 aa15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 Q6ZUG5 572 aa15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LRRC8DQ7L1W4 858 aa15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GPRASP2Q96D09 838 aa15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GPR20Q99678 358 aa15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CKBP12277 381 aa15.32■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FOSL2P15408 326 aa15.32■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP15.32■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CDC27P30260 824 aa15.32■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 APOBRQ0VD83 1088 aa15.32■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GRIN2CQ14957 1233 aa15.32■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BRF1Q92994 677 aa15.32■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.32■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 C17orf102A2RUQ5 167 aa15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 STXBP3O00186 592 aa15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MAFGO15525 162 aa15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FOSP01100 380 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ITGB5P18084 799 aa15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RPS6KB1P23443 525 aa15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ADD1P35611 737 aaKnown RBP15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ADCY7P51828 1080 aa15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SP4Q02446 784 aa15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MTMR1Q13613 665 aa15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FBXL16Q8N461 479 aa15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GLT8D2Q9H1C3 349 aa15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC28A3Q9HAS3 691 aa15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BARHL2Q9NY43 387 aa15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa15.31■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SMCO2A6NFE2 343 aa15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 BAIAP3O94812 1187 aa15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GNAT1P11488 350 aa15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KCNA2P16389 499 aa15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RABGGTBP53611 331 aa15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HIC1Q14526 733 aa15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TYW1BQ6NUM6 668 aa15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATP6V0A1Q93050 837 aa15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SLC9A7Q96T83 725 aa15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 JADE2Q9NQC1 790 aa15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa15.3■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ATP9AO75110 1047 aa15.29■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 HOXC8P31273 242 aa15.29■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GPNMBQ14956 572 aa15.29■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP15.29■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.29■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF618Q5T7W0 954 aa15.29■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SERINC5Q86VE9 423 aa15.29■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SEPT1Q8WYJ6 367 aa15.29■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AGXT2Q9BYV1 514 aa15.29■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RNPEPQ9H4A4 650 aa15.29■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.29■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NBNO60934 754 aa15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CXCL10P02778 98 aa15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SCG2P13521 617 aa15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 THPOP40225 353 aa15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KCNJ6P48051 423 aa15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AP3B2Q13367 1082 aa15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TRIM50Q86XT4 487 aa15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 WNT8BQ93098 351 aa15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MXRA8Q9BRK3 442 aa15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ANO3Q9BYT9 981 aa15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PKD2L1Q9P0L9 805 aa15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TELO2Q9Y4R8 837 aa15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP15.28■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYH7BA7E2Y1 1941 aa15.27■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 NID2Q14112 1375 aa15.27■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIF28PB7ZC32 967 aa15.27■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TREHO43280 583 aa15.27■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYOGP15173 224 aa15.27■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms