RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417497.5

TTC28-AS1-202, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TTC28-AS1, Length 627 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MFSD5Q6N075 450 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TRIM50Q86XT4 487 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CCDC148Q8NFR7 591 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LRCH3Q96II8 777 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GPR20Q99678 358 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MXRA8Q9BRK3 442 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C16orf70Q9BSU1 422 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 JADE2Q9NQC1 790 aa15.18■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DEXIO95424 95 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CTDNEP1O95476 244 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LGALS2P05162 132 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ARP10275 920 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GNA11P29992 359 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CCL23P55773 120 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NLRP5P59047 1200 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CEP55Q53EZ4 464 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TEX2Q8IWB9 1127 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C7orf31Q8N865 590 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CDHR1Q96JP9 859 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 UIMC1Q96RL1 719 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SENP7Q9BQF6 1050 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KCNH7Q9NS40 1196 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HDAC6Q9UBN7 1215 aa15.17■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HAS3O00219 553 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CDKL5O76039 1030 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ACRP10323 421 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF76P36508 570 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PTGISQ16647 500 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TMEM199Q8N511 208 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 BICD2Q8TD16 824 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CRYGNQ8WXF5 182 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CTAGE1Q96RT6 745 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KIF2CQ99661 725 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KATNAL1Q9BW62 490 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 WNT8AQ9H1J5 351 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SH3GLB2Q9NR46 395 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NOD1Q9Y239 953 aa15.16■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FAM86B1E9PN63 330 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 H3BRB1 525 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MEIS1O00470 390 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FAM86B2P0C5J1 330 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 HIC1Q14526 733 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C16orf59Q7L2K0 433 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SESTD1Q86VW0 696 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GTF3C6Q969F1 213 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SCLYQ96I15 445 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 C22orf23Q9BZE7 217 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GJB4Q9NTQ9 266 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 KCNJ14Q9UNX9 436 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LAMA3Q16787 3333 aa15.15■□□□□ 0.02
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DOCK5Q9H7D0 1870 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MYH7BA7E2Y1 1941 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MAFGO15525 162 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NPY5RQ15761 445 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 LRIT3Q3SXY7 679 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MCTP2Q6DN12 878 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PCDHA4Q9UN74 947 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 STK36Q9NRP7 1315 aa15.14■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 JAK2O60674 1132 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 CYP3A4P08684 503 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ST3GAL1Q11201 340 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 BLIDQ8IZY5 108 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SLC9A2Q9UBY0 812 aa15.13■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 EDIL3O43854 480 aa15.12■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FDPSP14324 419 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 MARK3P27448 753 aa15.12■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 FOSBP53539 338 aa15.12■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 PRR16Q569H4 304 aa15.12■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 TMEM240Q5SV17 173 aa15.12■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 ZNF365Q70YC5 407 aa15.12■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NIPA1Q7RTP0 329 aa15.12■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
TTC28-AS1-202ENST00000417497 SEPT1Q8WYJ6 367 aa15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms