RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 TNNI3KQ59H18 835 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-209ENST00000415046 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-209ENST00000415046 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-209ENST00000415046 CARFQ8N187 725 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-209ENST00000415046 Q8N1Y9 231 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-209ENST00000415046 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-209ENST00000415046 LGR4Q9BXB1 951 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-209ENST00000415046 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-209ENST00000415046 CAPN10Q9HC96 672 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-209ENST00000415046 ACTR10Q9NZ32 417 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-209ENST00000415046 DUOX2Q9NRD8 1548 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-209ENST00000415046 DEPDC5O75140 1603 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-209ENST00000415046 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-209ENST00000415046 MROH1Q8NDA8 1641 aa6.53□□□□□ -1.36
PTPRK-209ENST00000415046 PREX1Q8TCU6 1659 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 CYP2C8P10632 490 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 SLC6A11P48066 632 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 RTP5Q14D33 572 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 IQCEQ6IPM2 695 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF227Q86WZ6 799 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 MIB1Q86YT6 1006 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 BTN2A2Q8WVV5 523 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 BDH2Q9BUT1 245 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 USP40Q9NVE5 1235 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 NTMQ9P121 344 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 KIF15Q9NS87 1388 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 PTPRKQ15262 1439 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 MYO5BQ9ULV0 1848 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 B2RBV5 119 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 SGSM2O43147 1006 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 TBX1O43435 398 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 NOBOXO60393 691 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 EFEMP1Q12805 493 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 TESK1Q15569 626 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 SEC14L1Q92503 715 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 DDX11Q96FC9 970 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 MRVI1Q9Y6F6 885 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 ADGRL2O95490 1459 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 PTPRMP28827 1452 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 UNC13BO14795 1591 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 C22orf46C9J442 243 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 KIF3BO15066 747 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 SUSD5O60279 629 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 SCG5P05408 212 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 ITGAVP06756 1048 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 HOXC12P31275 282 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 GJA9P57773 515 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 NFKB2Q00653 900 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 KCNAB2Q13303 367 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 MROH9Q5TGP6 573 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 GGT6Q6P531 493 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 NLRP10Q86W26 655 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 VPS37DQ86XT2 251 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC103Q8IW40 242 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 PCDH18Q9HCL0 1135 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 BTG4Q9NY30 223 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 FPR2P25090 351 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 SARSP49591 514 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 LNPKQ9C0E8 428 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 X6R8D5 127 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 NCOA1Q15788 1441 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 ERBINQ96RT1 1412 aa6.49□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 ARNTLO00327 626 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 ADRB1P08588 477 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 THBS2P35442 1172 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 GTF2A2P52657 109 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 PLP2Q04941 152 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-209ENST00000415046 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
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