RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411858.1

CCZ1B-202, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 5

Gene CCZ1B, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-202ENST00000411858 TRIM22Q8IYM9 498 aa28.33■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 C16orf70Q9BSU1 422 aa28.33■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 UMODL1Q5DID0 1318 aa28.33■■■□□ 2.13
CCZ1B-202ENST00000411858 MAFGO15525 162 aa28.32■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 F2P00734 622 aa28.32■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa28.32■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 CYP2C9P11712 490 aa28.32■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 GNA11P29992 359 aa28.32■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 FPGSQ05932 587 aa28.32■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 MTMR1Q13613 665 aa28.32■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 CRYGNQ8WXF5 182 aa28.32■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 CDHR1Q96JP9 859 aa28.32■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 AIFM3Q96NN9 605 aa28.32■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 GPR20Q99678 358 aa28.32■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 ALG1Q9BT22 464 aa28.32■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 HIPK3Q9H422 1215 aa28.32■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 SH3GLB2Q9NR46 395 aa28.32■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 DEXIO95424 95 aa28.31■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 MFSD10Q14728 455 aa28.31■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 ME3Q16798 604 aa28.31■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 SESTD1Q86VW0 696 aa28.31■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 RASGRP4Q8TDF6 673 aa28.31■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 LARGE1O95461 756 aa28.3■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 CTDNEP1O95476 244 aa28.3■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 ARP10275 920 aa28.3■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 ARHGAP4P98171 946 aa28.3■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 KIAA0753Q2KHM9 967 aa28.3■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 C16orf59Q7L2K0 433 aa28.3■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 CTAGE1Q96RT6 745 aa28.3■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 KIF2CQ99661 725 aa28.3■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 KCNH7Q9NS40 1196 aa28.3■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 PKD2L1Q9P0L9 805 aa28.3■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 HDAC6Q9UBN7 1215 aa28.3■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 DOCK5Q9H7D0 1870 aa28.29■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 MEIS1O00470 390 aa28.29■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 NOP56O00567 594 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 CSF2RAP15509 400 aa28.29■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 CEP55Q53EZ4 464 aa28.29■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 NECAB1Q8N987 351 aa28.29■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 CCDC148Q8NFR7 591 aa28.29■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 KATNAL1Q9BW62 490 aa28.29■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa28.29■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 EDIL3O43854 480 aa28.28■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 LGALS2P05162 132 aa28.28■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 CYP3A4P08684 503 aa28.28■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 NLRP5P59047 1200 aa28.28■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 SP4Q02446 784 aa28.28■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 MCTP2Q6DN12 878 aa28.28■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 TMEM199Q8N511 208 aa28.28■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 GUCD1Q96NT3 240 aa28.28■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 WNT8AQ9H1J5 351 aa28.28■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa28.28■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 CCL23P55773 120 aa28.27■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 HIC1Q14526 733 aa28.27■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 PTGISQ16647 500 aa28.27■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 C7orf31Q8N865 590 aa28.27■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 BICD2Q8TD16 824 aa28.27■■■□□ 2.12
CCZ1B-202ENST00000411858 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa28.26■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 FAM86B1E9PN63 330 aa28.26■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 H3BRB1 525 aa28.26■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 FAM86B2P0C5J1 330 aa28.26■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 ZNF76P36508 570 aa28.26■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 CDKL5O76039 1030 aa28.25■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP28.25■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 NPY5RQ15761 445 aa28.25■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 NIPA1Q7RTP0 329 aa28.25■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP28.25■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 C22orf23Q9BZE7 217 aa28.25■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 PCDHA4Q9UN74 947 aa28.25■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa28.24■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 ACRP10323 421 aa28.24■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 FDPSP14324 419 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 ZNF697Q5TEC3 545 aa28.24■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 TRIM50Q86XT4 487 aa28.24■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 SEPT1Q8WYJ6 367 aa28.24■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 GTF3C6Q969F1 213 aa28.24■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 VWCEQ96DN2 955 aa28.24■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 SCLYQ96I15 445 aa28.24■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 FAM161BQ96MY7 647 aa28.24■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 STK36Q9NRP7 1315 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 M0R2N6 131 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP28.23■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 TMEM240Q5SV17 173 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 PLA2G4DQ86XP0 818 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 GJB4Q9NTQ9 266 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 KCNJ14Q9UNX9 436 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 NOD1Q9Y239 953 aa28.23■■■□□ 2.11
CCZ1B-202ENST00000411858 NFASCO94856 1347 aa28.22■■■□□ 2.11
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