RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409911.5

LRRTM4-205, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,976 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-205ENST00000409911 SULT2A1Q06520 285 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 COX10Q12887 443 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 ZBTB17Q13105 803 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 ADAM9Q13443 819 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 GPR162Q16538 588 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 CCDC122Q5T0U0 273 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 SESTD1Q86VW0 696 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 OSTM1Q86WC4 334 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 LILRB2Q8N423 598 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 MSANTD4Q8NCY6 345 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 KIFAP3Q92845 792 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 TCEANC2Q96MN5 208 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 CGREF1Q99674 301 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 MTUS1Q9ULD2 1270 aa7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
LRRTM4-205ENST00000409911 RREB1Q92766 1687 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 FLOT1O75955 427 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ITGA6P23229 1130 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 VARSP26640 1264 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 XRCC4Q13426 336 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 CRY1Q16526 586 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ANO6Q4KMQ2 910 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SARM1Q6SZW1 724 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 RUFY3Q7L099 469 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 NDUFAF2Q8N183 169 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 CNBD1Q8NA66 436 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 GIPC2Q8TF65 315 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 MAP4K1Q92918 833 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 MAP3K14Q99558 947 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 PLA2G12BQ9BX93 195 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 BHMT2Q9H2M3 363 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 IGSF5Q9NSI5 407 aa7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 OPLAHO14841 1288 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 STX6O43752 255 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ZBED4O75132 1171 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 TUBBP07437 444 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 IL15P40933 162 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 AK2P54819 239 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ST3GAL1Q11201 340 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 VPS72Q15906 364 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 BCL2A1Q16548 175 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 MAP3K11Q16584 847 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 MUM1Q2TAK8 710 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 IQCEQ6IPM2 695 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 TRIM65Q6PJ69 517 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ANKRD49Q8WVL7 239 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 TUBB4BP68371 445 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 MSL1Q68DK7 614 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 CCDC110Q8TBZ0 833 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SMC6Q96SB8 1091 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 IER2Q9BTL4 223 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 PFDN4Q9NQP4 134 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 GTF3C4Q9UKN8 822 aa7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 TAF5LO75529 589 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 UBL4AP11441 157 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SKIP12755 728 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 CTSWP56202 376 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 PDE1BQ01064 536 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 AMPD3Q01432 767 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SPECC1Q5M775 1068 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SLC51AQ86UW1 340 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 SIX5Q8N196 739 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 TNIP2Q8NFZ5 429 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 PARVGQ9HBI0 331 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 STK39Q9UEW8 545 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 CHMP2BQ9UQN3 213 aa7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LRRTM4-205ENST00000409911 JCADQ9P266 1359 aa7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms