RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394272.7

HDDC3-202, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HDDC3, Length 1,880 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-202ENST00000394272 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 IWS1Q96ST2 819 aa22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 C7orf25Q9BPX7 421 aa22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 TEKT3Q9BXF9 490 aa22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 TRIM9Q9C026 710 aa22.77■■□□□ 1.24
HDDC3-202ENST00000394272 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 SV2BQ7L1I2 683 aa22.76■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.76■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.76■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 GPRASP2Q96D09 838 aa22.76■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.76■■□□□ 1.23
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HDDC3-202ENST00000394272 STAM2O75886 525 aa22.75■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 RPN1P04843 607 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 AMPD3Q01432 767 aa22.75■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 MCM6Q14566 821 aa22.75■■□□□ 1.23
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HDDC3-202ENST00000394272 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.75■■□□□ 1.23
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HDDC3-202ENST00000394272 UNC45AQ9H3U1 944 aa22.75■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 MROH8Q9H579 483 aa22.75■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 POTEB2H3BUK9 544 aa22.75■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 KLRC4O43908 158 aa22.75■■□□□ 1.23
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HDDC3-202ENST00000394272 MAFGO15525 162 aa22.74■■□□□ 1.23
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HDDC3-202ENST00000394272 POTEGQ6S5H5 508 aa22.74■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.74■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.74■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 RMND1Q9NWS8 449 aa22.74■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 LRRC37A2A6NM11 1700 aa22.74■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 CHMP2AO43633 222 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 SEMA3FQ13275 785 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 KCNB1Q14721 858 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 NLRX1Q86UT6 975 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.73■■□□□ 1.23
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HDDC3-202ENST00000394272 PORCNQ9H237 461 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 MYMKA6NI61 221 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 E9PMD0 336 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 ATP9AO75110 1047 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 EDNRBP24530 442 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 EPHA7Q15375 998 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.73■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.73■■□□□ 1.23
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HDDC3-202ENST00000394272 DACH1Q9UI36 760 aa22.72■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.72■■□□□ 1.23
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HDDC3-202ENST00000394272 CCNA1P78396 465 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 FSTL1Q12841 308 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 NCAPHQ15003 741 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 STXBP2Q15833 593 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 FGD4Q96M96 766 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 MMP19Q99542 508 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.71■■□□□ 1.23
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HDDC3-202ENST00000394272 PLXNB2O15031 1838 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa22.71■■□□□ 1.23
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HDDC3-202ENST00000394272 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 CDHR1Q96JP9 859 aa22.71■■□□□ 1.23
HDDC3-202ENST00000394272 DOCK5Q9H7D0 1870 aa22.7■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 AP5Z1O43299 807 aa22.7■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 FCER1AP12319 257 aa22.7■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 SLC12A3P55017 1021 aa22.7■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 PSMC6P62333 389 aa22.7■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 ASIC1P78348 528 aa22.7■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 GNPTABQ3T906 1256 aa22.7■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 DYDC2Q96IM9 177 aa22.7■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 DNM3Q9UQ16 869 aa22.7■■□□□ 1.22
HDDC3-202ENST00000394272 WDR81Q562E7 1941 aa22.7■■□□□ 1.22
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