RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 VWCEQ96DN2 955 aa31.07■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 C6orf50Q9HD87 102 aa31.07■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 GRXCR1A8MXD5 290 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 SORBS3O60504 671 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 NFRKBQ6P4R8 1299 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 KAT2BQ92831 832 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM260Q9NX78 707 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 MYH7BA7E2Y1 1941 aa31.06■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 SPDYE3A6NKU9 549 aa31.05■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa31.05■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 CCND2P30279 289 aa31.05■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 GNA11P29992 359 aa31.04■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 SP2Q02086 613 aa31.04■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 SLC17A8Q8NDX2 589 aa31.04■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP31.04■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 PGBD1Q96JS3 809 aa31.04■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 FOSP01100 380 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 FGBP02675 491 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 MCM2P49736 904 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 NLRP5P59047 1200 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 AP3B2Q13367 1082 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 OTOP2Q7RTS6 562 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 HERVK_113Q902F9 699 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 TMX3Q96JJ7 454 aa31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 DNAJB2P25686 324 aa31.02■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 PBX2P40425 430 aa31.02■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 LAMC2Q13753 1193 aa31.02■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 PCNX4Q63HM2 1172 aa31.02■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 WASF1Q92558 559 aa31.02■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 ANO3Q9BYT9 981 aa31.02■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 GJB4Q9NTQ9 266 aa31.02■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 SCN5AQ14524 2016 aa31.02■■■□□ 2.56
GNPTAB-202ENST00000392919 NPY5RQ15761 445 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 DGKDQ16760 1214 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 MYSM1Q5VVJ2 828 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 XRRA1Q6P2D8 792 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 BICD2Q8TD16 824 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 RASGRP4Q8TDF6 673 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 CTAGE1Q96RT6 745 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 ALG1Q9BT22 464 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 BCAS3Q9H6U6 928 aa31.01■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF286BP0CG31 522 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 PPTC7Q8NI37 304 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 MYLIPQ8WY64 445 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 PBX4Q9BYU1 374 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 PCDHA4Q9UN74 947 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 KCNJ14Q9UNX9 436 aa31■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 STAM2O75886 525 aa30.99■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 GGPS1O95749 300 aa30.99■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 PTGISQ16647 500 aa30.99■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 HSDL1Q3SXM5 330 aa30.99■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 PHF20Q9BVI0 1012 aa30.99■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 EHMT1Q9H9B1 1298 aa30.99■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 RTEL1Q9NZ71 1219 aa30.99■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 PSEN2P49810 448 aa30.98■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 MCTP2Q6DN12 878 aa30.98■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 KCNV1Q6PIU1 500 aa30.98■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 DEFB128Q7Z7B8 93 aa30.98■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 DAGLBQ8NCG7 672 aa30.98■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM265A0A087WTH1 108 aa30.97■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 M0R2N6 131 aa30.97■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 XBP1P17861 261 aa30.97■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 SREBF1P36956 1147 aa30.97■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 GALNT17Q6IS24 598 aa30.97■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 SESTD1Q86VW0 696 aa30.97■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 BLIDQ8IZY5 108 aa30.97■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 TIFAQ96CG3 184 aa30.97■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 SPATA33Q96N06 139 aa30.97■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 HDAC6Q9UBN7 1215 aa30.97■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 NOD1Q9Y239 953 aa30.97■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 TGFB3P10600 412 aa30.96■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 SEMA3FQ13275 785 aa30.96■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 GRIN2CQ14957 1233 aa30.96■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 CRYGNQ8WXF5 182 aa30.96■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa30.96■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa30.95■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 HAS3O00219 553 aa30.95■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 F2P00734 622 aa30.95■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 IQCF3P0C7M6 154 aa30.95■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 ICAM3P32942 547 aa30.95■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 MFSD10Q14728 455 aa30.95■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 KIAA0753Q2KHM9 967 aa30.95■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF576Q9H609 170 aa30.95■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa30.95■■■□□ 2.55
GNPTAB-202ENST00000392919 TANC1Q9C0D5 1861 aa30.95■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms