RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390606.3

IGHV3-20-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-20, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene IGHV3-20, Length 415 nt, Biotype IG V gene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-20-201ENST00000390606 PCDHA4Q9UN74 947 aa25.14■■□□□ 1.62
IGHV3-20-201ENST00000390606 MEIS1O00470 390 aa25.13■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 F2P00734 622 aa25.13■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF286BP0CG31 522 aa25.13■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 ARP10275 920 aa25.13■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 RABEP1Q15276 862 aa25.13■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 NFRKBQ6P4R8 1299 aa25.13■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 GPR20Q99678 358 aa25.13■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 C16orf70Q9BSU1 422 aa25.13■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRPV6Q9H1D0 765 aa25.13■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.13■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM86B1E9PN63 330 aa25.12■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 HAS3O00219 553 aa25.12■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 EDIL3O43854 480 aa25.12■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM86B2P0C5J1 330 aa25.12■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 GALNT17Q6IS24 598 aa25.12■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 BADQ92934 168 aa25.12■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBC1D32Q96NH3 1257 aa25.12■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.12■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 DOCK5Q9H7D0 1870 aa25.12■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 JAK2O60674 1132 aa25.11■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 PSEN2P49810 448 aa25.11■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 NIPA1Q7RTP0 329 aa25.11■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 SESTD1Q86VW0 696 aa25.11■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 BLIDQ8IZY5 108 aa25.11■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 PHF20Q9BVI0 1012 aa25.11■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 PKD2L1Q9P0L9 805 aa25.11■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 KCNJ14Q9UNX9 436 aa25.11■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa25.1■■□□□ 1.61
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IGHV3-20-201ENST00000390606 CIITAP33076 1130 aa25.1■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZNF76P36508 570 aa25.1■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 KATNAL1Q9BW62 490 aa25.1■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 TIMP1P01033 207 aa25.09■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 LGALS2P05162 132 aa25.09■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 RAG1P15918 1043 aa25.09■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 SP4Q02446 784 aa25.09■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 MFSD10Q14728 455 aa25.09■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 FAM47CQ5HY64 1035 aa25.09■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 WASF1Q92558 559 aa25.09■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 ALG1Q9BT22 464 aa25.09■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 BACH2Q9BYV9 841 aa25.09■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.09■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 CHMP4BP1P59074 171 aa25.08■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
IGHV3-20-201ENST00000390606 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.08■■□□□ 1.61
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IGHV3-20-201ENST00000390606 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.08■■□□□ 1.61
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IGHV3-20-201ENST00000390606 A0A1W2PPC1 479 aa25.07■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa25.07■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 XBP1P17861 261 aa25.07■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 CTAGE1Q96RT6 745 aa25.07■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa25.07■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 HDAC6Q9UBN7 1215 aa25.07■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 H3BRB1 525 aa25.06■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa25.06■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP2C9P11712 490 aa25.06■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 USP11P51784 963 aa25.06■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 TRIM50Q86XT4 487 aa25.06■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 TBCKQ8TEA7 893 aa25.06■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 SEPT1Q8WYJ6 367 aa25.06■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 LENG9Q96B70 501 aa25.06■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa25.06■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 UMODL1Q5DID0 1318 aa25.06■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 MFSD5Q6N075 450 aa25.05■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 IL27Q8NEV9 243 aa25.05■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 OXER1Q8TDS5 423 aa25.05■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 HIPK3Q9H422 1215 aa25.05■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.05■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 ST18O60284 1047 aa25.04■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 CYP2C18P33260 490 aa25.04■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 EPHB4P54760 987 aa25.04■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 HIC1Q14526 733 aa25.04■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 PRR16Q569H4 304 aa25.04■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 KRT25Q7Z3Z0 450 aa25.04■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 C7orf31Q8N865 590 aa25.04■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 SDF4Q9BRK5 362 aa25.04■■□□□ 1.6
IGHV3-20-201ENST00000390606 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
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