RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 MTUS1Q9ULD2 1270 aa16.2■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 DOCK5Q9H7D0 1870 aa16.19■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 FIBPO43427 364 aa16.19■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 ERVK-21P61565 698 aa16.19■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 PTPROQ16827 1216 aa16.19■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 FAM117BQ6P1L5 589 aa16.19■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 XRRA1Q6P2D8 792 aa16.19■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 CASC1Q6TDU7 716 aa16.19■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 MYOCDQ8IZQ8 938 aa16.19■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 GDPD5Q8WTR4 605 aa16.19■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 SAMD11Q96NU1 681 aa16.19■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 ANO2Q9NQ90 1003 aa16.19■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 LCHNA4D1U4 455 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 LINC01553A4QN01 128 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 SLC27A2O14975 620 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 RGS20O76081 388 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 LGALS2P05162 132 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 GNAQP50148 359 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 KRT40Q6A162 431 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 METTL7BQ6UX53 244 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 NLRX1Q86UT6 975 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 FBXO22Q8NEZ5 403 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 APBB2Q92870 758 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 LZTS2Q9BRK4 669 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 C16orf70Q9BSU1 422 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 BDP1A6H8Y1 2624 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 NLRC5Q86WI3 1866 aa16.18■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 ICAM3P32942 547 aa16.17■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 SP2Q02086 613 aa16.17■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 GPNMBQ14956 572 aa16.17■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 CREB3L3Q68CJ9 461 aa16.17■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 TMTC2Q8N394 836 aa16.17■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 DBF4BQ8NFT6 615 aa16.17■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 IL31RAQ8NI17 732 aa16.17■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 CDHR1Q96JP9 859 aa16.17■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 YME1L1Q96TA2 773 aa16.17■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 MAP3K14Q99558 947 aa16.17■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa16.16■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 LPXNO60711 386 aa16.16■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 DDAH1O94760 285 aa16.16■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 ARHGEF15O94989 841 aa16.16■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 SMARCA1P28370 1054 aa16.16■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 ANTXR2P58335 489 aa16.16■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 TROAPQ12815 778 aa16.16■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 NFXL1Q6ZNB6 911 aa16.16■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 CYFIP1Q7L576 1253 aa16.16■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 RSPH3Q86UC2 560 aa16.16■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 MTA3Q9BTC8 594 aa16.16■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 SUGCTQ9HAC7 445 aa16.16■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 SENP2Q9HC62 589 aa16.16■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa16.16■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 CCDC69A6NI79 296 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 CALM1P0DP23 149 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 CALM2P0DP24 149 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 CALM3P0DP25 149 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 TIGD5Q53EQ6 642 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 PCNX4Q63HM2 1172 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 PIBF1Q8WXW3 757 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 FAM122AQ96E09 287 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 SENP7Q9BQF6 1050 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 SPZ1Q9BXG8 430 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 EHMT1Q9H9B1 1298 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 RTEL1Q9NZ71 1219 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 FRMPD4Q14CM0 1322 aa16.15■□□□□ 0.18
CITED1-202ENST00000373619 TREHO43280 583 aa16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 ARHGAP4P98171 946 aa16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 MBTPS1Q14703 1052 aa16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 RASEFQ8IZ41 740 aa16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 WNT8BQ93098 351 aa16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 GPR20Q99678 358 aa16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 FAM50BQ9Y247 325 aa16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 NRCAMQ92823 1304 aa16.14■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 PIK3CDO00329 1044 aa16.13■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 CYTH3O43739 400 aa16.13■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 CTSHP09668 335 aa16.13■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 HOXC8P31273 242 aa16.13■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 MCM5P33992 734 aa16.13■□□□□ 0.17
CITED1-202ENST00000373619 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.7 ms