RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000354241.5

TRIM4-202, Transcript of tripartite motif containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRIM4, Length 1,942 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4-202ENST00000354241 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 UNC45AQ9H3U1 944 aa23■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 POTEFA5A3E0 1075 aa22.99■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 E9PMD0 336 aa22.99■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 AP5Z1O43299 807 aa22.99■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 ASIC1P78348 528 aa22.99■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 POTEGQ6S5H5 508 aa22.99■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.99■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 ADCY5O95622 1261 aa22.98■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.98■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 COPB2P35606 906 aa22.98■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 CNTN2Q02246 1040 aa22.98■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 CYP4A11Q02928 519 aa22.98■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.98■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 KLRC4O43908 158 aa22.98■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP22.98■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.98■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.98■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 PPP1R9BQ96SB3 815 aa22.98■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 LRRC27Q9C0I9 530 aa22.98■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 MYMKA6NI61 221 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 POTEB2H3BUK9 544 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 ERVK-9P63128 1117 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 ERVK-24P63145 666 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 NLRX1Q86UT6 975 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 DNERQ8NFT8 737 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 RGL1Q9NZL6 768 aa22.97■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 IKBKBO14920 756 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 PLA2G4BP0C869 781 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 TPM4P67936 248 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 MYL5Q02045 173 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 KCNB1Q14721 858 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 DYDC2Q96IM9 177 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 NCAPHQ15003 741 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 WDR78Q5VTH9 848 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 DYMQ7RTS9 669 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 GPRASP2Q96D09 838 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 EXOC1Q9NV70 894 aa22.96■■□□□ 1.27
TRIM4-202ENST00000354241 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 IWS1Q96ST2 819 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 DNM3Q9UQ16 869 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 GDAQ9Y2T3 454 aa22.95■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 RHOBTB3O94955 611 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 PDE4DQ08499 809 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 EPHA7Q15375 998 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 TPH2Q8IWU9 490 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 DDX12PQ92771 950 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 ASTN1O14525 1302 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 ATP9AO75110 1047 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 STAM2O75886 525 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 PSMC6P62333 389 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 MMP19Q99542 508 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 MROH8Q9H579 483 aa22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 SLITRK3O94933 977 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 KCTD2Q14681 263 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 STXBP2Q15833 593 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 GPBP1Q86WP2 473 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 TRIM5Q9C035 493 aa22.93■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 MAFGO15525 162 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 RGS20O76081 388 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 SEMA3FQ13275 785 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 GNPTABQ3T906 1256 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 UNC13DQ70J99 1090 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 SAMM50Q9Y512 469 aa22.92■■□□□ 1.26
TRIM4-202ENST00000354241 PGK2P07205 417 aa22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms