RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 MAN1A1P33908 653 aa17.77■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 LMNB2Q03252 620 aa17.77■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 SLFNL1Q499Z3 407 aa17.77■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL23Q86XA0 190 aa17.77■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 ZHX2Q9Y6X8 837 aa17.77■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 VPS41P49754 854 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 CYB5R4Q7L1T6 521 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 RMDN3Q96TC7 470 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 THAP12O43422 761 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 MESDQ14696 234 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 SLFN12LQ6IEE8 588 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF653Q96CK0 615 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX25Q9H3E2 840 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 GCNT4Q9P109 453 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 PASKQ96RG2 1323 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 GSG1L2A8MUP6 293 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 K7ERI5 159 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 PPFIA4O75335 1185 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 RFX1P22670 979 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 VSIG1Q86XK7 387 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 C2orf69Q8N8R5 385 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC44A5Q8NCS7 719 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM20AQ96MK3 541 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 HOMER3Q9NSC5 361 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 USP17L10C9JJH3 530 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 ZBTB7AO95365 584 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 GRM4Q14833 912 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM167AQ96KS9 214 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 LY9Q9HBG7 655 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 PFDN4Q9NQP4 134 aa17.76■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 ORC4O43929 436 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 FDX1P10109 184 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 GUCY2FP51841 1108 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 RBL2Q08999 1139 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D22BQ9NU19 505 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 QRICH2Q9H0J4 1663 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 STXBP2Q15833 593 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 PTPROQ16827 1216 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 MCPH1Q8NEM0 835 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM149B1Q96BN6 582 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 CABS1Q96KC9 395 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 CRAMP1Q96RY5 1269 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 ATF2P15336 505 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 CDC23Q9UJX2 597 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 DLC1Q96QB1 1528 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 MED7O43513 233 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRN2O75325 713 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 MYO1EQ12965 1108 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 MTMR1Q13613 665 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 RESP18Q5W5W9 173 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC170Q8IYT3 715 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 NEDD1Q8NHV4 660 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 ABCB11O95342 1321 aa17.75■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 Q3C1V9 767 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC62Q6P9F0 684 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 NME8Q8N427 588 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 TCP11Q8WWU5 503 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 NDST4Q9H3R1 872 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPK4P31152 587 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 SNAP25P60880 206 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 UNC13DQ70J99 1090 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 CEP57Q86XR8 500 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 DPH5Q9H2P9 285 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 LRFN2Q9ULH4 789 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 WDR64B1ANS9 1081 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 SGMS1Q86VZ5 419 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 NEK9Q8TD19 979 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 MXD3Q9BW11 206 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa17.74■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 F5H6K3 240 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 KRT76Q01546 638 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 KLRC3Q07444 240 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 C10orf76Q5T2E6 689 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF233A6NK53 670 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 PFDN6O15212 129 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 RNF40O75150 1001 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 STX2P32856 288 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 H7C0C1 242 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 LDHAP00338 332 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 DDIT3P35638 169 aa17.73■□□□□ 0.43
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP5OP48047 213 aa17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms