RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328024.10

RAB11B-201, Transcript of RAB11B, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB11B, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11B-201ENST00000328024 LAMC2Q13753 1193 aa22.89■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 CDHR1Q96JP9 859 aa22.89■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.89■■□□□ 1.26
RAB11B-201ENST00000328024 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 NEDD9Q14511 834 aa22.89■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.89■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.89■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 GJA10Q969M2 543 aa22.89■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 SPATA33Q96N06 139 aa22.89■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.89■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 DHX15O43143 795 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 SLC37A4O43826 429 aa22.88■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 MMP3P08254 477 aa22.88■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 GSE1Q14687 1217 aa22.88■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 Q4G0T1 1027 aa22.88■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 METTL7BQ6UX53 244 aa22.88■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.88■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 A0A1W2PQY0 241 aa22.87■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 MSH4O15457 936 aa22.87■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 CPT1AP50416 773 aa22.87■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.87■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.87■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
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RAB11B-201ENST00000328024 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 SYT1P21579 422 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 H3BQV1 296 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 MYL3P08590 195 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 DDIT3P35638 169 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 PURAQ00577 322 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 SP4Q02446 784 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 IFFO2Q5TF58 517 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 GPR20Q99678 358 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF577Q9BSK1 485 aa22.86■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 NFASCO94856 1347 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 MCTP1Q6DN14 999 aa22.85■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 GRIN2DO15399 1336 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 ZEB2O60315 1214 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 CCNE2O96020 404 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 ATP2B1P20020 1258 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 PSMC6P62333 389 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 KAT2BQ92831 832 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 SLC5A5Q92911 643 aa22.84■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RAB11B-201ENST00000328024 PPFIA4O75335 1185 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 DGKDQ16760 1214 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 POTEDQ86YR6 584 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 SDF4Q9BRK5 362 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 SLC9A2Q9UBY0 812 aa22.83■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF286BP0CG31 522 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 HAS1Q92839 578 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 GLT1D1Q96MS3 346 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 STARD7Q9NQZ5 370 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.82■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 PDCP20941 246 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 MTMR6Q9Y217 621 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 ALPK3Q96L96 1907 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 ACTR2P61160 394 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 TBC1D22BQ9NU19 505 aa22.81■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 ELP1O95163 1332 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 KPNA6O60684 536 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 PSMD10O75832 226 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 CABYRO75952 493 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 PTMSP20962 102 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 SNX17Q15036 470 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 ZNF174Q15697 407 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 FERMT3Q86UX7 667 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 TRIM50Q86XT4 487 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 PCYT2Q99447 389 aa22.8■■□□□ 1.24
RAB11B-201ENST00000328024 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
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