RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDHR1Q96JP9 859 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR20Q99678 358 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALG1Q9BT22 464 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf50Q9HD87 102 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.36■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 LGALS2P05162 132 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSF2RAP15509 400 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM199Q8N511 208 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 PKD2L1Q9P0L9 805 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.35■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 PFKFB2O60825 505 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEXIO95424 95 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 SP4Q02446 784 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 C16orf59Q7L2K0 433 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.34■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCN5AQ14524 2016 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNA11P29992 359 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL23P55773 120 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP4P98171 946 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD1Q15327 319 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTGISQ16647 500 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP55Q53EZ4 464 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 C7orf31Q8N865 590 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 KCNH7Q9NS40 1196 aa22.33■■□□□ 1.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAFGO15525 162 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM50Q86XT4 487 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL23AQ9NPF7 189 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOD1Q9Y239 953 aa22.32■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 H3BRB1 525 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 LARGE1O95461 756 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACRP10323 421 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIC1Q14526 733 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 MCTP2Q6DN12 878 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 BICD2Q8TD16 824 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCLYQ96I15 445 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 AIFM3Q96NN9 605 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 STK36Q9NRP7 1315 aa22.31■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM86B1E9PN63 330 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 MEIS1O00470 390 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 PITPNM1O00562 1244 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDKL5O76039 1030 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 CYP3A4P08684 503 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARP10275 920 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEK4P51957 841 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM240Q5SV17 173 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 VWCEQ96DN2 955 aa22.3■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 CTDNEP1O95476 244 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 HOXC8P31273 242 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLRP5P59047 1200 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ME3Q16798 604 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 NFASCO94856 1347 aa22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 DTNBO60941 627 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF76P36508 570 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 RBL2Q08999 1139 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 BFSP2Q13515 415 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPY5RQ15761 445 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 RASIP1Q5U651 963 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR153Q6NV75 609 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF365Q70YC5 407 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAGE1Q8TC20 777 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 GTF3C6Q969F1 213 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.28■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.27■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.27■■□□□ 1.16
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