RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC15A5A6NIM6 579 aa17.79■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 NFIBO00712 420 aa17.79■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 STRNO43815 780 aa17.79■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 LONP1P36776 959 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 GRB14Q14449 540 aa17.79■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 NSMFQ6X4W1 530 aa17.79■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 DPP9Q86TI2 863 aa17.79■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 MED15Q96RN5 788 aa17.79■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 MCOLN1Q9GZU1 580 aa17.79■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 KCND1Q9NSA2 647 aa17.79■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 FBXO40Q9UH90 709 aa17.79■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa17.79■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF18P17022 549 aa17.78■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 CASP1P29466 404 aa17.78■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 E2F4Q16254 413 aa17.78■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 TKFCQ3LXA3 575 aa17.78■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 VSTM4Q8IW00 320 aa17.78■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 USP27XA6NNY8 438 aa17.78■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 COBLO75128 1261 aa17.78■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 MAP2K5Q13163 448 aa17.78■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 PDXDC2PQ6P474 469 aa17.78■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 SOCS4Q8WXH5 440 aa17.78■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 CLEC4DQ8WXI8 215 aa17.78■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 ZMYND12Q9H0C1 365 aa17.78■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 ELNP15502 786 aa17.77■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 RGS2P41220 211 aa17.77■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 INF2Q27J81 1249 aa17.77■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa17.77■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 NPLOC4Q8TAT6 608 aa17.77■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 TBC1D5Q92609 795 aa17.77■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 USP6NLQ92738 828 aa17.77■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCB11O95342 1321 aa17.77■□□□□ 0.44
TSNARE1-201ENST00000307180 NRDCO43847 1150 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 NAPAP54920 295 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 PRMT2P55345 433 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 CCL14Q16627 93 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 DTHD1Q6ZMT9 781 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 STAMQ92783 540 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 PNMA2Q9UL42 364 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 SMCO2A6NFE2 343 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 ADCY3O60266 1144 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 CD44P16070 742 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 SPATA1Q5VX52 437 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 ABRAQ8N0Z2 381 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 SH3TC2Q8TF17 1288 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 C6orf50Q9HD87 102 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 INTS13Q9NVM9 706 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa17.76■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 MYCP01106 439 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 TXLNAP40222 546 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 CNTN2Q02246 1040 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 DMTNQ08495 405 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 CUL4BQ13620 913 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 PTPN14Q15678 1187 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 CEP135Q66GS9 1140 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 NYAP1Q6ZVC0 841 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 APBA2Q99767 749 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM60Q9H2L4 133 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 CYP39A1Q9NYL5 469 aa17.75■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 CFBP00751 764 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 GNA11P29992 359 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 CDC25AP30304 524 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 KCNJ6P48051 423 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 IRF5Q13568 498 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC30A10Q6XR72 485 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 RNF207Q6ZRF8 634 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 KRT25Q7Z3Z0 450 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 MTRQ99707 1265 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 BLZF1Q9H2G9 400 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 FLRT1Q9NZU1 646 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 LAD1O00515 517 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 GRK4P32298 578 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 KLHL10Q6JEL2 608 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 TRIB2Q92519 343 aa17.74■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 PFASO15067 1338 aa17.73■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 POTEB2H3BUK9 544 aa17.73■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 OPLAHO14841 1288 aa17.73■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 PRPHP41219 470 aa17.73■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 RPS6P62753 249 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
TSNARE1-201ENST00000307180 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.435e-6■■■■□ 20.9
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF792Q3KQV3 632 aa17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms