RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 FGD4Q96M96 766 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 PLIN2Q99541 437 aa23.29■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 CA12O43570 354 aa23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 NT5C3AQ9H0P0 336 aa23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1468Q9P260 1216 aa23.28■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 CHMP2AO43633 222 aa23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC192P0DO97 292 aa23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 GRB10Q13322 594 aa23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 PNOCQ13519 176 aa23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 GRB14Q14449 540 aa23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 SASS6Q6UVJ0 657 aa23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 MAGEF1Q9HAY2 307 aa23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-201ENST00000298838 STK17AQ9UEE5 414 aa23.27■■□□□ 1.32
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PACSIN3-201ENST00000298838 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 PAGE5Q96GU1 130 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 PNMA5Q96PV4 448 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 UNC45AQ9H3U1 944 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXN1O15353 648 aa23.26■■□□□ 1.31
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PACSIN3-201ENST00000298838 SEMA3FQ13275 785 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF792Q3KQV3 632 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM119Q4V9L6 283 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 HYIQ5T013 277 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 B3GNT9Q6UX72 402 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 FUCA2Q9BTY2 467 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 TSPY26PQ9H489 355 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 ASB14A6NK59 587 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 EML1O00423 815 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP9AO75110 1047 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 RPA1P27694 616 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 AFMP43652 599 aa23.25■■□□□ 1.31
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PACSIN3-201ENST00000298838 MCM3APO60318 1980 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 COBLO75128 1261 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 ICAM3P32942 547 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 DPP9Q86TI2 863 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 MORC4Q8TE76 937 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
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PACSIN3-201ENST00000298838 MED24O75448 989 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNA2P16389 499 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT76Q01546 638 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 TYRO3Q06418 890 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 POTEBQ6S5H4 581 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 SEPT14Q6ZU15 432 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC15Q8TF66 581 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 KBTBD4Q9NVX7 518 aa23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 ECM1Q16610 540 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 GAS2L3Q86XJ1 694 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1024Q9UPX6 916 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 NFASCO94856 1347 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 SMC2O95347 1197 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 PRR29P0C7W0 189 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 EPHA7Q15375 998 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 RAD54LQ92698 747 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 TUFT1Q9NNX1 390 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 MYL1P05976 194 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP4A11Q02928 519 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 ARMCX2Q7L311 632 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 NEK9Q8TD19 979 aa23.22■■□□□ 1.31
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PACSIN3-201ENST00000298838 SMARCE1Q969G3 411 aa23.22■■□□□ 1.31
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PACSIN3-201ENST00000298838 HSD17B14Q9BPX1 270 aa23.22■■□□□ 1.31
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PACSIN3-201ENST00000298838 SAMM50Q9Y512 469 aa23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 DOCK5Q9H7D0 1870 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 POTEFA5A3E0 1075 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 TGFB3P10600 412 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 SFNP31947 248 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 JAK3P52333 1124 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 AMPD3Q01432 767 aa23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-201ENST00000298838 POTEGQ6S5H5 508 aa23.21■■□□□ 1.31
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