RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289382.7

CNOT11-201, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNOT11, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT11-201ENST00000289382 ASIC1P78348 528 aa20.65■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 RRAGAQ7L523 313 aa20.65■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.65■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 MMRN2Q9H8L6 949 aa20.65■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 SLC24A3Q9HC58 644 aa20.65■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 RAD51CO43502 376 aa20.65■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.65■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa20.65■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.65■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 NLRP3Q96P20 1036 aa20.65■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 TRIM9Q9C026 710 aa20.65■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 RREB1Q92766 1687 aa20.65■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 TM4SF1P30408 202 aa20.64■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 HSD17B3P37058 310 aa20.64■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 IFFO1Q0D2I5 559 aa20.64■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 XRCC4Q13426 336 aa20.64■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP20.64■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 KIRREL3Q8IZU9 778 aa20.64■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.64■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa20.64■□□□□ 0.9
CNOT11-201ENST00000289382 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.64■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 FTCDO95954 541 aa20.64■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 FMNL3Q8IVF7 1028 aa20.64■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 SETDB2Q96T68 719 aa20.64■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 MAD2L2Q9UI95 211 aa20.64■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.64■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.64■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 EP400Q96L91 3159 aa20.64■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 PALMO75781 387 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 NFIXQ14938 502 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 CABP7Q86V35 215 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 FLT1P17948 1338 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 GRID2IPA4D2P6 1211 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 C5orf60A6NFR6 353 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 RTN2O75298 545 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 RPSAP08865 295 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 ZNF844Q08AG5 666 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 VWA3BQ502W6 1294 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 KIAA0895Q8NCT3 520 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 SLC39A2Q9NP94 309 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 STX8Q9UNK0 236 aa20.63■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 H0YGN5 161 aa20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 M0R2N6 131 aa20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 GNPATO15228 680 aa20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 MGRN1O60291 552 aa20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 TXNRD1Q16881 649 aa20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 C12orf60Q5U649 245 aa20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 KLHL7Q8IXQ5 586 aa20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 NDST4Q9H3R1 872 aa20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 NFS1Q9Y697 457 aa20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 SEMA3FQ13275 785 aa20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 NAA25Q14CX7 972 aa20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa20.62■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 ECHS1P30084 290 aa20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 ERVK-9P63128 1117 aa20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 ODF2Q5BJF6 829 aa20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 BAP1Q92560 729 aa20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 RAPGEF5Q92565 580 aa20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 TATDN2Q93075 761 aa20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 HVCN1Q96D96 273 aa20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 PPP2R2AP63151 447 aa20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 TNNC1P63316 161 aa20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 BIRC3Q13489 604 aa20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 SBK1Q52WX2 424 aa20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 ISCUQ9H1K1 167 aa20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.61■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.6■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 MYBP10242 640 aa20.6■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 MSL1Q68DK7 614 aa20.6■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.6■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 CCT6BQ92526 530 aa20.6■□□□□ 0.89
CNOT11-201ENST00000289382 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms