RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 COA7Q96BR5 231 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 ANKARQ7Z5J8 1434 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 MXI1P50539 228 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 SESN3P58005 492 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 ALCAMQ13740 583 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PRPSAP1Q14558 356 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 PGBD1Q96JS3 809 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CYP27A1Q02318 531 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 RASGRF1Q13972 1273 aa22.9■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CUL1Q13616 776 aa22.89■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.89■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.89■■□□□ 1.26
CCSAP-201ENST00000284617 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 STK36Q9NRP7 1315 aa22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 SLC16A2P36021 539 aa22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 MSH2P43246 934 aa22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 ANO3Q9BYT9 981 aa22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 SORBS3O60504 671 aa22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 USP14P54578 494 aa22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 CCDC188H7C350 402 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 MCF2LO15068 1137 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 MYO5CQ9NQX4 1742 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 CLGNO14967 610 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 OATP04181 439 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 ERFEQ4G0M1 354 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 FMO2Q99518 471 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 WDR19Q8NEZ3 1342 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 NR1D1P20393 614 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 SERPINB6P35237 376 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 ITKQ08881 620 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 KLHL29Q96CT2 875 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 ABCB6Q9NP58 842 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 CEP170P1Q96L14 293 aa22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 GOLGA8CPA6NN73 597 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 RASGRF2O14827 1237 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 USP17L8P0C7I0 530 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 ECE1P42892 770 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 DNAJC24Q6P3W2 148 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 TUBB6Q9BUF5 446 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 UBXN2AP68543 259 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 RNF169Q8NCN4 708 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 KRT1P04264 644 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 SNX1Q13596 522 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 MMEL1Q495T6 779 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 SYDE2Q5VT97 1194 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 HAUS8Q9BT25 410 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 MEIS1O00470 390 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 STAT2P52630 851 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 PLCB4Q15147 1175 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.87■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 ROBO2Q9HCK4 1378 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 DR1Q01658 176 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 MED7O43513 233 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 SRGAP2BP0DMP2 458 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 SAT1P21673 171 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 NLRP7Q8WX94 980 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM94Q12767 1356 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 LRRD1A4D1F6 860 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 CPP00450 1065 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 KCTD2Q14681 263 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 FAM47CQ5HY64 1035 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 MTA3Q9BTC8 594 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 RCAN1P53805 252 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 JADE1Q6IE81 842 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 TCP11Q8WWU5 503 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.86■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 TTC36A6NLP5 189 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 TMED2Q15363 201 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 BAG5Q9UL15 447 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa22.85■■□□□ 1.25
CCSAP-201ENST00000284617 SDCCAG3Q96C92 435 aa22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms