RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 SOD2P04179 222 aa4.75□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 CELA3BP08861 270 aa4.75□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 GPR85P60893 370 aa4.75□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa4.75□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 TMC5Q6UXY8 1006 aa4.75□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 OTOP3Q7RTS5 596 aa4.75□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 IFNL3Q8IZI9 196 aa4.75□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.651e-6■■■■□ 20
GPBP1-201ENST00000264779 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa4.75□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 LNPKQ9C0E8 428 aa4.75□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 RBPJLQ9UBG7 517 aa4.75□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 ASH2LQ9UBL3 628 aa4.75□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 SPIRE1Q08AE8 756 aa4.74□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 FAM209AQ5JX71 171 aa4.74□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 FOXB2Q5VYV0 432 aa4.74□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 CYP4F22Q6NT55 531 aa4.74□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 TRIM48Q8IWZ4 208 aa4.74□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 CLIC6Q96NY7 704 aa4.74□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 ALG1Q9BT22 464 aa4.74□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 CCDC113Q9H0I3 377 aa4.74□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 SIRPGQ9P1W8 387 aa4.74□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 LTFP02788 710 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 PLP2Q04941 152 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 TUSC3Q13454 348 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 PRR31Q5SQ13 230 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 DPH6Q7L8W6 267 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 CLEC4DQ8WXI8 215 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 IPPKQ9H8X2 491 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 CROTQ9UKG9 612 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 WASF3Q9UPY6 502 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 SERINC3Q13530 473 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 FAM26FQ5R3K3 315 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 PHF19Q5T6S3 580 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 SCUBE1Q8IWY4 988 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 TMEM209Q96SK2 561 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 L2HGDHQ9H9P8 463 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 DSEQ9UL01 958 aa4.73□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 KDM2BQ8NHM5 1336 aa4.72□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 MROH6A6NGR9 719 aa4.72□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 FAM153BP0C7A2 387 aa4.72□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF28P17035 718 aa4.72□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 RASA3Q14644 834 aa4.72□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa4.72□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 VASNQ6EMK4 673 aa4.72□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 FAM124AQ86V42 546 aa4.72□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 PTPRN2Q92932 1015 aa4.72□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 EXOC2Q96KP1 924 aa4.72□□□□□ -1.65
GPBP1-201ENST00000264779 FAM221BA6H8Z2 402 aa4.71□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 AQP7O14520 342 aa4.71□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 PAK1Q13153 545 aa4.71□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 TTLL11Q8NHH1 800 aa4.71□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 ARMC5Q96C12 935 aa4.71□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 CD244Q9BZW8 370 aa4.71□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 SNTG2Q9NY99 539 aa4.71□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 TELO2Q9Y4R8 837 aa4.71□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 NUB1Q9Y5A7 615 aa4.71□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.71□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 IL13P35225 146 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 GUCY1A3Q02108 690 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 KIAA2012Q0VF49 1180 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 BORAQ6PGQ7 559 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 KCTD1Q719H9 257 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 WRNIP1Q96S55 665 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 CYP7B1O75881 506 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 FAHP16930 419 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 RBL2Q08999 1139 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 PROSER1Q86XN7 944 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 LGI4Q8N135 537 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 TMEM168Q9H0V1 697 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 DLL4Q9NR61 685 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 CATSPERZQ9NTU4 200 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 HSPBP1Q9NZL4 362 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 FTSJ1Q9UET6 329 aa4.7□□□□□ -1.66
GPBP1-201ENST00000264779 INVSQ9Y283 1065 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms