RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 PLEKHA8P1O95397 391 aa24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 LGALS2P05162 132 aa24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 HIC1Q14526 733 aa24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 SERINC5Q86VE9 423 aa24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 ATP6V0A1Q93050 837 aa24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 ASB2Q96Q27 587 aa24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 SENP7Q9BQF6 1050 aa24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 ANO2Q9NQ90 1003 aa24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 EMSYQ7Z589 1322 aa24.25■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 RFXAPO00287 272 aa24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 THPOP40225 353 aa24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 SEMA3FQ13275 785 aa24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 TRAF7Q6Q0C0 670 aa24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 MICALL1Q8N3F8 863 aa24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 ARNTL2Q8WYA1 636 aa24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 WNT8BQ93098 351 aa24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 GPR20Q99678 358 aa24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 RNPEPQ9H4A4 650 aa24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 PSTPIP2Q9H939 334 aa24.24■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 RSPH10B2B2RC85 870 aa24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 RSPH10BP0C881 870 aa24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 GNAT1P11488 350 aa24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 RNF20Q5VTR2 975 aa24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 FANCBQ8NB91 859 aa24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 MTCH2Q9Y6C9 303 aa24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 VCANP13611 3396 aa24.23■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 LGR5O75473 907 aa24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 RXRAP19793 462 aa24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 HOXC8P31273 242 aa24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 DEFB103AP81534 67 aa24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 CDHR1Q96JP9 859 aa24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 RAD9AQ99638 391 aa24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 TTC28Q96AY4 2481 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 GJB5O95377 273 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 MBTPS1Q14703 1052 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 SGMS1Q86VZ5 419 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.21■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
NEDD8-201ENST00000250495 TREHO43280 583 aa24.2■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 CAND2O75155 1236 aa24.2■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGEF15O94989 841 aa24.2■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 TCTN1Q2MV58 587 aa24.2■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 CCDC82Q8N4S0 544 aa24.2■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 IL27Q8NEV9 243 aa24.2■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 GPRASP2Q96D09 838 aa24.2■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.2■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 EPOPA6NHQ4 379 aa24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 TMTC3Q6ZXV5 915 aa24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 NEK1Q96PY6 1258 aa24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 SETD4Q9NVD3 440 aa24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 PTPRSQ13332 1948 aa24.19■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 DOCK5Q9H7D0 1870 aa24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 TNFRSF10AO00220 468 aa24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 SP4Q02446 784 aa24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 AAK1Q2M2I8 961 aa24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 MICU3Q86XE3 530 aa24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 KAT6AQ92794 2004 aa24.18■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa24.17■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 LCHNA4D1U4 455 aa24.17■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 MAFGO15525 162 aa24.17■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 AMHP03971 560 aa24.17■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 GRB10Q13322 594 aa24.17■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa24.17■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 NRCAMQ92823 1304 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 ATP9AO75110 1047 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 TRIM50Q86XT4 487 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 SEPT1Q8WYJ6 367 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 SEPT8Q92599 483 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 LMCD1Q9NZU5 365 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHA6Q9UN73 950 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 INSL6Q9Y581 213 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa24.16■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 KCNA2P16389 499 aa24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 ITGB5P18084 799 aa24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 ARHGAP4P98171 946 aa24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 UBE2SQ16763 222 aa24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 TSGA10IPQ3SY00 556 aa24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 FAM117BQ6P1L5 589 aa24.15■■□□□ 1.46
NEDD8-201ENST00000250495 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.15■■□□□ 1.467e-16■■■□□ 19.1
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