RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 DPP9Q86TI2 863 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 CHST13Q8NET6 341 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 SPZ1Q9BXG8 430 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ACAD9Q9H845 621 aa29.49■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
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CAPNS1-201ENST00000246533 CYP2C19P33261 490 aa29.47■■■□□ 2.31
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CAPNS1-201ENST00000246533 TUBB4BP68371 445 aa29.47■■■□□ 2.31
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CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC34Q96HJ3 373 aa29.47■■■□□ 2.31
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF18P17022 549 aa29.46■■■□□ 2.31
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CAPNS1-201ENST00000246533 ISM2Q6H9L7 571 aa29.46■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 ABRAQ8N0Z2 381 aa29.46■■■□□ 2.31
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CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G4AP47712 749 aa29.45■■■□□ 2.31
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CAPNS1-201ENST00000246533 LRRN4CLQ8ND94 238 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 APBA2Q99767 749 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 CEP131Q9UPN4 1083 aa29.45■■■□□ 2.31
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa29.45■■■□□ 2.3
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CAPNS1-201ENST00000246533 RCAN1P53805 252 aa29.45■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBB2AQ13885 445 aa29.45■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 POSTNQ15063 836 aa29.45■■■□□ 2.3
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CAPNS1-201ENST00000246533 FGD4Q96M96 766 aa29.45■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 TUBB2BQ9BVA1 445 aa29.45■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 CARD6Q9BX69 1037 aa29.45■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 AMNQ9BXJ7 453 aa29.45■■■□□ 2.3
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CAPNS1-201ENST00000246533 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa29.45■■■□□ 2.3
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF792Q3KQV3 632 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 TKFCQ3LXA3 575 aa29.44■■■□□ 2.3
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CAPNS1-201ENST00000246533 AIFM3Q96NN9 605 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 LZTS2Q9BRK4 669 aa29.44■■■□□ 2.3
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CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF236Q9UL36 1845 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 LCTP09848 1927 aa29.44■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC30A10Q6XR72 485 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PXYLP1Q8TE99 480 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PHKBQ93100 1093 aa29.43■■■□□ 2.3
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CAPNS1-201ENST00000246533 UBXN6Q9BZV1 441 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 V9GY48 417 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 SMARCA1P28370 1054 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 SMARCE1Q969G3 411 aa29.43■■■□□ 2.3
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CAPNS1-201ENST00000246533 INTS13Q9NVM9 706 aa29.43■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 MAN1B1Q9UKM7 699 aa29.43■■■□□ 2.3
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CAPNS1-201ENST00000246533 INHAP05111 366 aa29.42■■■□□ 2.3
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CAPNS1-201ENST00000246533 MORC3Q14149 939 aa29.42■■■□□ 2.3
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CAPNS1-201ENST00000246533 SLAIN1Q8ND83 568 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF333Q96JL9 665 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 CLIC6Q96NY7 704 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 MCM3APO60318 1980 aa29.42■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP1P03956 469 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 TC2NQ8N9U0 490 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP29.41■■■□□ 2.3
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGHA2P01877 340 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 GNG11P61952 73 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 RPS6P62753 249 aaKnown RBP29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ARMC5Q96C12 935 aa29.41■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 SOWAHBA6NEL2 793 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 CALML3P27482 149 aa29.4■■■□□ 2.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa29.4■■■□□ 2.3
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